Welche Arten haben ihre Genome sequenziert/werden sequenziert?

Das Humangenomprojekt veröffentlichte vor fast zehn Jahren sein erstes vollständiges Genom. Seitdem wurden auch viele Arten sequenziert.

Ich versuche, eine Liste abgeschlossener (und möglicherweise laufender/initiierter) Projekte zu finden, die andere Arten sequenzieren, zusammen mit einigen sehr grundlegenden zusammenfassenden Daten wie der Anzahl der Gene (aufgeteilt auf Geschlechtschromosomen und Autosomen), der Länge der DNA, der Anzahl der Chromosomen usw .

Dies ist für eine Präsentation, die ich auf einer Konferenz halte, und würde eine schöne Ergänzung zu meinem Vortrag darstellen.

"laufend/initiiert" sind Daten, die Sie einfach nicht sammeln können. An einigen Universitäten laufen mehr Sequenzierungsprojekte, die nicht öffentlich erwähnt wurden (und oft auch nicht, bevor sie abgeschlossen sind), als ich zählen möchte. Ich bin an mindestens 2 beteiligt.

Antworten (4)

Die GOLD-Datenbank (Genomes Online DB) enthält Daten zum Sequenzierungsstatus und auch einige Statistiken (Anzahl der Chromosomen, Genomgröße) – aber diese zusätzlichen Daten sind nicht für alle Arten verfügbar.

Auf Wikipedia gibt es mehrere Listen, zum Beispiel für Pflanzen , Bakterien und Eukaryoten .

Das Genome 10K-Projekt zielt in ihren Worten darauf ab, „einen genomischen Zoo zusammenzustellen – eine Sammlung von DNA-Sequenzen, die die Genome von 10.000 Wirbeltierarten repräsentieren, ungefähr eine für jede Wirbeltiergattung“. Hier ist ihre Artenliste .

Bei NCBI finden Sie eine Tabelle mit Genominformationen pro Organismus .

Für jeden Organismus finden Sie das Königreich, die Gruppe und Untergruppe, zu der er gehört, die Größe in Megabasen, die Anzahl der Chromosomen, Organellen und Plasmide (falls vorhanden) und die Anzahl der Baugruppen.