Welche Beziehung besteht zwischen der Plasmidkonzentration und dem mRNA-Spiegel?

Angenommen ein einfaches synthetisches Konstrukt, bestehend aus einem konstitutiven Promotor und einem einzelnen Gen:

Eine der einfachsten Möglichkeiten, die GFP-Transkription zu modellieren, ist die Verwendung einer ODE:

$\frac{d [GFP_{mRNA}]}{dt} = a - b{\cdot}[GFP_{mRNA}]$

wo$a$ist die GFP-Transkriptionsrate und$b$ist die GFP-mRNA-Abbaurate (beide Konstanten). Normalerweise gehen wir davon aus$a>>b$.

Angenommen, wir möchten die Plasmidkonzentration mit dem Wert der Transkriptionsrate berücksichtigen$a$- zB bei höherer Plasmidkonzentration das Verhältnis$a/b$sollte ansteigen, da erwartet wird, dass die mRNA-Sättigungsniveaus schneller erreicht werden. Mit anderen Worten, angenommen, wir transfizieren 2 individuelle Konstrukte, die oben abgebildet sind, 10 ng von einem und 30 ng von dem anderen – wie sollte sich dieser Konzentrationsunterschied auf die Werte der Geschwindigkeitskonstanten auswirken, vorausgesetzt, die Konstrukte sind ansonsten identisch?

Davon ausgehend, wie hoch ist ungefähr die Gentranskriptionsrate?$a$Veränderung als Funktion der Menge an transfiziertem Plasmid, das das obige Konstrukt enthält? Idealerweise wäre ich daran interessiert, dies für HEK 293-Zellen zu wissen, aber jede andere anständige Schätzung ist akzeptabel. Eine einfache Möglichkeit besteht darin, einfach eine lineare Beziehung anzunehmen, aber ich denke, das ist zu einfach: zB wenn wir sagen$a=1$bei 10 ng Plasmidkonzentration, dann$a=3$bei 30 ng Plasmidkonzentration. Beachten Sie, dass ich mich nicht unbedingt auf ODE-Modelle beschränke, sondern nur nach einer Art Beziehung suche.

Bisher konnte ich in den von mir durchgesehenen Papieren nichts Nützliches finden, daher wäre ich für jede Hilfe dankbar.