Wie lautet die Formel zur Ermittlung der ec50-Reproduzierbarkeit in Bezug auf die Dosis-Wirkungs-Kurven für einige Medikamente?

Der EC50 wird bestimmt, indem eine Standardkurve an die experimentell erhaltenen Kontrollwerte für jede Dosis-Antwort-Kurve angepasst wird, wobei eine Software verwendet wird, die Versuche und Vergleiche durchführt, bis sie zufriedenstellend sind (nichtlineare Regression).

In der Literatur wird erwähnt, dass experimentell gewonnene Kontrollwerte für die Dosis-Wirkungs-Kurven EC50 reproduzierbar sind. Nach meinem derzeitigen Verständnis sind die EC50-Werte, die für verschiedene Dosis-Antwort-Kurven erhalten wurden, tatsächlich „nahe genug“ (in einem formalen statistischen Sinne) beieinander. Gibt es ein Verfahren oder eine Formel zur formellen Feststellung der EC50-Reproduzierbarkeit?

Danke :)

Willkommen bei Biologie SE. Was meinst du mit "Versuch und Irrtum"? Die EC50-Analyse wird normalerweise durch nichtlineare Regression durchgeführt, typischerweise mit einer gewissen Sigmoidfunktion. Es gibt viele Methoden zum Schätzen von Varianzen / Konfidenzintervallen für Parameter in der nichtlinearen Regression. Wenn Sie also etwas mehr Details zu Ihrem spezifischen Modell und Ihren Daten angeben können, könnte dies hilfreich sein. Auch die Statistik SE könnte für Ihre Frage geeignet sein.
Hallo Roland, danke für deine Antwort! Eigentlich kann ich aus Ihrer Antwort besser formulieren, was ich fragen wollte. Grundsätzlich wird ein Sigmoid mit nichtlinearer Regression an experimentelle Daten angepasst, wie Sie für jedes Experiment sagten. Das Ziel ist nun, die Reproduzierbarkeit dieser Sigmoide für zusätzliche Experimente (Dosis-Antwort-Kurven) zu schließen. Vergleichen Sie also im Grunde die Anpassungsparameter (EC50, Steigung) und stellen Sie fest, dass sie einem konzentrierten Muster folgen. Einige Forscher bezeichnen dies in Artikeln als „EC50-Reproduzierbarkeit“. Ich habe mich gefragt, ob es weit verbreitete Methoden gibt, um diese Reproduzierbarkeit festzustellen.
Und die Daten selbst sind übrigens vertraulich. Aber das verwendete Modell ist im Grunde ein Sigmoid, wie Sie erwähnt haben. Danke für Ihre Antwort.
Wenn Sie mehrere EC50-Schätzungen aus separaten unabhängigen Messreihen haben, sollte es dann leicht zu erkennen sein, ob sie übereinstimmen? Sie könnten +/- std dev der EC59-Werte meinen (unter der Annahme einer Normalverteilung), aber ich persönlich bevorzuge es, die Daten nur tabellarisch / graphisch darzustellen. Wenn die Daten knapp sind, ist das meist offensichtlich. Schwieriger wird es, wenn es nur eine Messreihe gibt und einige Abweichungsschätzungen aus der Regressionsanalyse abgeleitet werden müssen.
Das DRCPaket im Artikel aus meiner Antwort enthält Funktionen zum direkten Vergleich von Parametern wie der Steigung aus nichtlinearen Regressionen.
Danke für deine Antwort Michael_A. Ich schaue mir den Artikel an.

Antworten (1)

Die verschiedenen Modelle, die verwendet werden können, um die Kurven anzupassen, unterscheiden sich. Das verlinkte Papier und diese Website beschreiben die Unterschiede; Die Diskussion dreht sich um ein RPaket namens, DRCaber viele der Informationen sind allgemein anwendbar. Modellierung kann auch verwendet werden, um ED50 abzuschätzen .

Die verwendeten Parameter und Modelle müssen mit der untersuchten Biologie übereinstimmen. Wenn es angemessen ist, kann das Skalieren der Ober- und Untergrenzen Ihrer Daten die Konsistenz der ED50-Schätzungen verbessern, da dadurch das Modell diese Parameter nicht mehr schätzen muss. So etwas kann zum Skalieren verwendet werden;

(VALUE - topdrugmean)/(nodrugmean-topdrugmean)

Das Akaike-Informationskriterium kann verwendet werden, um die Anpassungsgüte für verschiedene Modelle zu messen (siehe die vorangehenden Links).

Wie lautet die Formel zur Ermittlung der ec50-Reproduzierbarkeit in Bezug auf die Dosis-Wirkungs-Kurven für einige Medikamente?
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