Wie lese ich ein RNA-Expressionsmuster?

Wenn man über Krankheiten liest, kann man Links zu Proteinen und den damit verbundenen Genen finden, ein Beispiel dafür ist hier .

Ich frage mich, wie ich als Nicht-Spezialist auf diesem Gebiet die folgende Grafik entschlüsseln/lesen soll:

RNA-Expressionsmuster

Was soll das alles heißen?

Dies ist kein besonders spezialisiertes Diagramm, daher müssen Sie (und wir) wie bei jedem anderen Diagramm wissen, was die Achsen sind, was die Farbcodierung bedeutet und was203411_s_at (dh die Titelinformationen) bedeutet. Gibt es eine Figurenlegende? Wenn ja, geben Sie es bitte in Ihrer Frage an. Ich könnte erklären, worum es meiner Meinung nach geht, aber Sie müssen sich zuerst etwas Mühe geben.

Antworten (1)

Dieses Bild zeigt die Expression eines Gens (in Ihrem Fall Lamin A/C) in verschiedenen Geweben. Ein Bild mit einem höheren Ergebnis für die Maus sieht so aus (von hier aus ):Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Sie sehen die mittlere Expression (berechnet aus allen Proben) und können auch sehen, in welchen Geweben dieses Gen stark exprimiert wird und in welchen es weniger oder keine Expression gibt.

Das ist wichtig, wenn man die Funktion eines Gens analysieren möchte. Das gewebespezifische Expressionsmuster kann zwischen verschiedenen Geweben stark variieren (wie Sie in der Abbildung sehen können), was Informationen über die Funktion des Gens geben kann. Das Gleiche gilt, wenn man sich die zeitliche Verteilung der Genexpression ansieht, kann man Gene identifizieren, die für verschiedene Differenzierungsschritte wichtig sind.

Das macht sehr viel Sinn. Um sicherzugehen, dass ich es verstehe, zeigt die obige Grafik, dass Lungengewebe dieses spezifische Gen (im Durchschnitt) mehr exprimiert als alle anderen Gewebe? Was bedeuten die Zahlen?
@UltimateHawk Ja, genau. Ich bin mir über die Zahl im Moment nicht sicher, aber ich denke, sie sind relativ zu einer gewissen Normalisierung.
Wie lese ich ein RNA-Expressionsmuster?
AntwortenHierDatenschutz-Bestimmungen1y, 0v