Wie viel Prozent der DNA eines Neandertalers könnte in einem Denisovan stecken?

Meine Fragen ergaben sich aus einem Online-Kursvideo bei 3:11-19

Der Professor erwähnte, dass die Neandertaler durch Inzucht mit ihren Cousins ​​​​zusammen gezüchtet wurden, aber die Denisova-Menschen waren sehr vielfältig, mit 70% Neandertaler-DNA , es wurde eine Vermischung zwischen Denisova-Menschen und einer noch früheren mysteriösen Spezies gefunden. Folgendes sind meine Fragen:

  1. Meinte er damit, dass die meisten Neandertaler zu Inzucht neigen? Warum?

  2. Ich bin mir nicht sicher, ob das genau das war, was er damit meinte, dass 70 % der DNA des Neandertalers in einem Denisovan existieren könnten . Wenn das wahr wäre, warum nannte man es dann nicht einfach Neandertaler, wenn nur 30 % keine Neandertaler sind?

Antworten (1)

Sie sollten sehr vorsichtig sein, wenn Sie versuchen, etwas aus dem zu schließen, was über die Neandertaler-Genetik bekannt ist.

Um Frage 1 zu beantworten: NEIN! Das hat er wohl nicht gemeint. Bis heute haben wir nur zwei qualitativ hochwertige vollständige Genome von archaischen Menschen , eines ist das (Neandertaler aus der Denisova-Höhle, genannt Altai-Neandertaler ( Prüfer et al., 2014 )) und eines ist das (Denisovan aus der Denisova-Höhle ( Meyer et. al., 2012 )). Aus dieser Stichprobe (die genau ein Neandertaler ist) kann man keinen Rückschluss auf die Gesamtpopulation ziehen. Es scheint jedoch, dass dieses Neandertaler-Individuum aus dem Altai-Gebirge tatsächlich Inzucht war (hohe Homozygotie im Genom) - es sagt uns jedoch nicht einmal, in welcher Weise ihre Eltern verwandt waren. Prüferet al. (2014) schreiben

Wir schließen daraus, dass die Eltern dieses Neandertalers entweder Halbgeschwister mit gemeinsamer Mutter, doppelte Cousins ​​ersten Grades, ein Onkel und eine Nichte, eine Tante und ein Neffe, ein Großvater und eine Enkelin oder eine Großmutter und ein Enkel waren.

Mehr kann man nicht sagen. Sie können auch nicht sagen, ob dies auf eine Präferenz bei der Partnerwahl zurückzuführen war oder auf die Tatsache, dass diese Gruppe sehr isoliert war oder dass diese Population eine extrem kleine effektive Populationsgröße hatte (beachten Sie, dass diskutiert wird, ob die letzten beiden Effekte tatsächlich sind Äquivalent).
Um es kurz zu machen: Auf der Grundlage der verfügbaren Daten ist es nicht ratsam, allgemeine Schlüsse über das Paarungsverhalten der Neandertaler zu ziehen. Altai ist das einzige Beispiel, bei dem direkte Inzucht nachgewiesen werden konnte, alle anderen genetischen Daten von Neandertalern deuten darauf hin, dass die genetische Vielfalt nur gering war.

Um Frage 2 zu beantworten: Ich weiß nicht genau, was das bedeutet, 70 % Neandertaler-DNA in Densiovanern. Ich kann Ihnen nur allgemein etwas über die Unterschiede zwischen Densiovan und Neandertalern sagen. Der Densiovan ist möglicherweise die einzige (zumindest Säugetier-)Art, die allein auf der Grundlage genetischer Informationen definiert wurde. Alles, was gefunden wurde, waren ein paar Zähne und ein kleiner Knochen. Die Leute dachten, dies sei ein weiterer Neandertaler. Nach der Sequenzierung der DNA von diesen Knochen bis zu einer hohen Abdeckung (vage, ein Qualitätsmaß) fand man heraus, dass die DNA beide außerhalb der Variation des modernen Menschen liegt – was zeigt, dass dies kein Homo sapiens war, aber interessanterweise fällt es auch deutlich außerhalb der Variation bekannter Neandertaler-Sequenzen – was zeigt, dass dies kein Neandertaler war. Es wurde auch deutlich, dass Densiovaner enger mit Neandertalern verwandt sind als mit modernen Menschen (man fragt sich jetzt vielleicht, wie das mit nur einem Genom möglich ist. Tatsächlich sind mehr genetische Daten verfügbar: Genome mit geringer Abdeckung, Exomsequenzen , mtDNA und alle zeigen dasselbe: Neandertaler und Densiovaner sind unterschiedlich, aber enger miteinander verwandt als mit dem modernen Menschen). Insgesamt scheinen Denisova-Menschen auch eine eher geringe genetische Vielfalt gehabt zu haben (was übrigens auch ein Merkmal des modernen Menschen ist).
Um es kurz zu machen: Es scheint Vermischungsereignisse zwischen Denisova-Menschen und Neandertalern gegeben zu haben, aber ich weiß nicht, wie ich das auf die 70% beziehen soll. Prüferet al. (2014) entdeckten etwa 0,5 % Beitrag von Neandertalern in Denisova-Menschen.

Ein letzter Kommentar zu dieser mysteriösen Spezies (niemand sagt es, aber die meisten Leute denken an Homo erectus ): Noch einmal, Prüfer et al. (2014) fanden einige interessante Muster des Teilens abgeleiteter Allele zwischen heutigen Afrikanern, Denisova-Menschen und Neandertalern (dies sollte für Afrikaner-Denisova- und Afrikaner-Neandertaler-Vergleiche gleich sein, aber heutige Afrikaner teilen etwa 7 % mehr abgeleitete Allele mit Neandertalern als bei Densiovanern - sogar 13-16 % in Allelen, die bei heutigen Afrikanern festgelegt sind). Dies ist entweder eine uralte Populationsstruktur (allerdings mit sehr tiefen Abstammungslinien) oder, wie in der Veröffentlichung vorgeschlagen, aufgrund des Genflusses von einem (genetisch) unbekannten archaischen Hominin in Denisova-Menschen.

Ich hoffe, das klärt die Sache ein wenig auf. Fühlen Sie sich frei, im Kommentar zu fragen, und ich werde den Beitrag bearbeiten, da er möglicherweise etwas unstrukturiert ist.

Können Sie erklären, was Sie erwähnt haben - "Insgesamt scheinen Denisova-Menschen auch eine eher geringe genetische Vielfalt gehabt zu haben (was übrigens auch ein Merkmal moderner Menschen ist)" - Wie Sie sagten, scheinen beide Arten eher gering zu sein genetische Vielfalt, aber mit wem vergleichen wir ? Bedeutet das, dass das Video einen Fehler enthält, in dem erwähnt wird, dass die Denisova-Menschen sehr vielfältig waren? -?
Ich vergleiche die genetische Vielfalt zwischen "relevanten" Arten, die eine vergleichbare Evolutionsgeschichte haben und eng miteinander verwandt sind, zB Menschenaffen: Schimpansen haben etwa 3-4 Mal mehr genetische Vielfalt als heutige moderne Menschen (und andere Menschenaffen noch mehr). Ich habe nicht das ganze Video gesehen, also bin ich vorsichtig, es einen Fehler zu nennen. In der oben zitierten Arbeit von Meyer (2012) finden Sie Hinweise darauf, dass die genetische Vielfalt bei Denisova-Menschen weitaus geringer war als bei heutigen modernen Menschen. Und ja, es scheint mehrere Genflussereignisse gegeben zu haben .
Vielen Dank für Ihre Antwort, aber ich verstehe immer noch nicht: Warum konnten sich "mehrere Genflussereignisse" nicht auf "hohe genetische Vielfalt" beziehen? Sind sie nicht gleichwertig? Um zu zitieren - die heutigen Afrikaner teilen etwa 7% mehr abgeleitete Allele bei Neandertalern als bei Densiovanern – (ich sage abschließend, dass das bedeutet, dass wir mit Neandertalern verwandter sind als mit Denisovans) und – Es wurde auch klar, dass Densiovaner enger mit Neandertalern verwandt sind als mit modernen Menschen – kann ich sagen, dass Neandertaler dazu neigten, sich zu kreuzen, sodass ihre genetische Vielfalt höher war als sowohl der moderne Mensch als auch der Denisova-Menschen?
Da verwechselst du einige Konzepte. 1. Genfluss verursacht nicht automatisch genetische Vielfalt. Wenn Sie einen Genfluss zwischen hypothetischen identischen Populationen haben, bleibt die Diversität konstant. Neandertaler und Denisova-Menschen waren eng miteinander verwandt – der Genfluss führte offensichtlich bei keiner von ihnen zu einer übermäßigen Diversität, da es beiden Populationen an einem hohen Grad an Diversität mangelte. 2. Die 7 % gemeinsamen abgeleiteten Allele bedeuten nicht, dass Neandertaler und Menschen enger miteinander verwandt sind als Menschen und Denisova-Menschen – sie teilen nur einige Haplotypen. Tatsächlich sind Menschen gleichermaßen mit Neandertalern und Denisova-Menschen verwandt .
(weiter) 3. Sie können nicht sagen, dass Neandertaler dazu neigen, sich zu kreuzen (siehe meine Antwort). Das verfügbare qualitativ hochwertige Genom stammt zufällig von einem Inzucht-Individuum. Sie werden Inzucht-Individuen in fast jeder Population finden, auch in heutigen modernen Menschen. Sie dürfen dies nicht auf die gesamte Bevölkerung verallgemeinern.) 4. Inzucht verursacht keine genetische Vielfalt. Im Gegensatz dazu verringert Inzucht die genetische Vielfalt , da nahe verwandte Individuen Allele durch Abstammung teilen, so dass Sie viele homozygote Stellen bei Inzucht-Individuen haben werden (Homzygotie ist stellvertretend für genetische Diversität).