Ich war kürzlich an Kollaborationen beteiligt, bei denen ich die Populationsgenetik eukaryotischer Populationen modellieren muss. Ich befürchte, dass ich bei vielen der bisherigen Techniken und Entscheidungen entweder "das Rad neu erfinden" oder konzeptionelle Fehler machen werde (z. B. Annahmen vereinfachen).
Ich würde mich sehr über Empfehlungen von Büchern über Populations-/Evolutionsgenetik oder Mikroevolution freuen, um mit diesen Ängsten umzugehen. Bevorzugte Kriterien sind:
Führt intuitiv Schlüsselkonzepte ein.
Schwerpunkt auf Modellierung mit Beispielen von Problemen und deren Lösungen.
Relativ kurz (ich plane, von vorne bis hinten zu lesen).
TL;DR
Ich würde Population Genetics: A Concise Guide (Gillespie) für eine Einführung in die Populations- / Evolutionsgenetik empfehlen (danke AGS, dass Sie diesen großen Fehler von mir in der ersten Version meiner Antwort hervorgehoben haben).
Ich würde A Biologist's guide to mathematische Modellierung in Evolution und Ökologie (Otto und Day) empfehlen, wenn Sie Ihr Wissen in Mathematik sicherstellen möchten, indem Sie deren Anwendung auf die Evolutionsbiologie lernen.
Allgemeine Eintragsbücher zur Populationsgenetik
Es gibt mehrere Bücher, die eine Einführung in die Populationsgenetik bieten. Ich habe Prinzipien der Populationsgenetik (Hartl & Clarke) gelesen . Ich weiß es zu schätzen, aber wenn ich Sie wäre, würde ich eher Elemente der Populationsgenetik (Charlesworth) oder Populationsgenetik (Hamilton) ausprobieren . Es gibt auch Populationsgenetik (Hedrick) . Ich würde eher denken, dass dieses letzte Buch viele empirische populationsgenetische Daten präsentiert und sich nicht so sehr auf theoretische Konzepte konzentriert wie die anderen (aber ich könnte mich irren). Gillespies Buch Population Genetics: A Concise Guideist ein Klassiker. Es ist kurz, sehr leicht verständlich und angenehm zu lesen. Gillespies Buch ist vielleicht etwas veraltet, aber ich würde es trotzdem sehr empfehlen.
Schwerpunkt Analytische Modellierung
A Biologist's guide to mathematische Modellierung in Evolution und Ökologie (Otto und Day) ist ein sehr gutes und leicht zugängliches Buch. Es gibt einen guten Überblick über alle Fächer, die normalerweise im ersten Studienjahr in Biologie unterrichtet werden, wie zum Beispiel lineare Algebra. Es ist sehr zugänglich und geht inzwischen ziemlich weit, indem es schließlich über die Anwendung der Diffusionsgleichung in der Populationsgenetik spricht (unter anderem Kimuras Arbeit). Dieses Buch stellt einige wichtige Modelle der Populationsgenetik vor, aber da es darauf abzielt, die Werkzeuge für die mathematische Modellierung in Ökologie und Evolution bereitzustellen, kann es einige Bereiche der Ökologie und Evolutionsbiologie unterberücksichtigen. Zum Beispiel spricht das Buch weder über Bevölkerungsstruktur noch über evolutionäre Spieltheorie und es gibt wenig über Koaleszenztheorie.
Andere Bücher, die spezifische Themen innerhalb der Populationsgenetik behandeln
Coalescent Theory: an Introduction (John Wakeley) ist ein gutes Buch. Ich habe es nicht vollständig gelesen, sowohl wegen Zeitproblemen als auch weil die Mathematik für mich etwas kompliziert ist. Die Koaleszenztheorie bietet einen sehr wichtigen Satz mathematischer Werkzeuge in der Evolutionsbiologie.
Es gibt auch Mathematische Populationsgenetik (Ewens) . Ich lese es gerade. Es ist definitiv kein einführendes Buch und es deckt wirklich nicht viele der häufigsten Bereiche der Populationsgenetik ab.
Wenn Sie sich besonders für die altersstrukturierte Bevölkerung interessieren, ist Evolution in age-structured populations (Charlesworth) ein sehr gutes Buch.
Modeling Evolution (Roff) bietet einige Diskussionen darüber, wie man Fitness aus phänotypischen Merkmalen mathematisch definieren kann. Obwohl es interessant ist, würde ich Ihnen nicht raten, es zu kaufen. Darüber hinaus ist die gesamte Mathematik recht einfach und zielt darauf ab, zu erklären, wie mathematische Modellierung mit R durchgeführt wird, was meiner Meinung nach nicht unbedingt zu lernen ist, da andere Sprachen im Umgang mit Mathematik besser funktionieren (Mathematica zum Beispiel).
Evolutionary Conservation Biology (Ferrière, Couvet und Dieckmann) ist ein sehr gutes Buch über Naturschutz und Naturschutzgenetik. Es entwickelt einige mathematische Modelle, die für die Erhaltung von Populationen und Gemeinschaften von besonderem Interesse sind.
Ecology, Genetics and Evolution in Metapopulations (Hanski und Gaggiotti) ist ein Buch, das Sie ebenfalls interessieren könnte. Es konzentriert sich jedoch viel mehr auf die Ökologie als die anderen, die ich oben zitiert habe. Hinweis: Ich habe es nicht vollständig gelesen.
Wenn Sie an der Auswahl von Verwandten und dem Grad der Auswahl interessiert sind, sollten Sie einen Blick auf Major Transitions In Evolution (Maynard Smith and Szathmary) werfen , der ein Klassiker ist (ich habe ihn allerdings nicht gelesen) oder The Major Transitions in Evolution Revisited ( Calcott und Sterelny) , die die Meinung vieler Autoren zu diesem Thema umfassen. Evolutionary Dynamics: Exploring the Equations of Life (Nowak) ist ebenfalls von Interesse, insb. für Epidemiologie-Interessierte. Schließlich möchten Sie vielleicht einen Blick auf die äußerst gut geschriebenen und leicht zu lesenden Bücher von Dawkins werfen, wie z. B. The extended phenotype (Dawkins)zum Beispiel. Die Dawkins-Bücher sind sehr beliebt und sehr, sehr einführend. Es bietet mehr eine Denkweise als die eigentliche Wissenschaft hinter der Evolutionsbiologie.
A Biologist's guide to mathematical modelling in evolution and ecology (Otto and Day)
(im Beitrag verlinkt) gibt eine einfache Einführung in Diffusionsgleichungen, geht aber nicht auf die Details ihrer Ableitungen ein. Ich hoffe, das hilftDie Liste von @Remi.b ist ausgezeichnet, sollte aber auch Gillespie's Population Genetics: A Concise Guide enthalten .
Nicht relativ kurz, aber ich werde eine Empfehlung wiederholen, die ich gerade in einem anderen Thread gemacht habe. Populationsgenetik und mikroevolutionäre Theorie von Alan Templeton deckt viele der oben aufgeführten Themen ab und befasst sich mit Beispielen intensiv mit dem Selbstlernen verschiedener Bevölkerungsstrukturstatistiken. Es ist ein einführendes Lehrbuch für Personen mit etwas statistischem Hintergrund (obwohl es auch einen statistischen Anhang enthält). Es gibt auch einige Diskussionen über Bayes'sche Inferenz und andere Modellierungsmethoden.
Ich persönlich mag die Primer on Population Biology von Wilson und Bossert. Für ein Buch, das fast 45 Jahre alt ist, hält es ziemlich gut. Eines der besten Dinge an diesem Buch ist, dass es Beispiele gibt und dann Schritt für Schritt durch die Lösungen geht. Hin und wieder wird es für diesen Biologen etwas zu mathematisch , aber insgesamt finde ich es lesbar und informativ.
Ich denke, dieses Buch erfüllt alle Ihre Kriterien sehr gut.
hallo_da_andy