Empfohlener Sequenz-Clustering-Algorithmus für Transkriptomdaten

Ich arbeite an einem Projekt, bei dem ich eine große Menge an Transkriptomdaten analysieren werde. Nachdem wir unsere RNA-Seq-Reads mit Trinity in Contigs zusammengestellt haben, sieht es so aus, als würde ich ungefähr 10 GB an Sequenzen im Fasta-Format haben. Da diese Sequenzen aus mehreren hundert Gewebebibliotheken stammen, aber von einer einzigen Art (Huhn), erwarte ich eine Menge Redundanz, daher möchte ich diese Sequenzen gruppieren und nur eine repräsentative Sequenz aus jedem Cluster als I verwenden Fahren Sie fort mit meiner Analyse. Ich sehe, dass es einige Tools gibt, die solche Dinge tun, und ich frage mich, welche Sie alle empfehlen würden. Ich werde dies auf einem Linux-Computer mit 64 CPU-Kernen und ~ 500 GB RAM ausführen.

Ich habe angefangen, mir USEARCH anzusehen, aber es scheint, dass ich mit der kostenlosen 32-Bit-Version auf einige Speicherprobleme stoßen werde, und so sehr ich auf ihrer Website herumgeklickt habe, konnte ich nicht herausfinden, wie viel die 64-Bit-Version kostet oder wie man es kauft.