Gibt es einen Begriff, der extrazelluläre „Transport“-Proteine ​​von membrangebundenen „Transport“-Proteinen unterscheidet?

Ich habe in meiner Freizeit Genetik und Biochemie erforscht und festgestellt, dass Proteine ​​wie Albumin und Apolipoproteine ​​den extrazellulären Transport erleichtern und Proteine ​​wie GLUT1, das Glukose durch die Zellmembran transportiert, oder MFSD12, das Cystein in die Melanosomen von Melanozyten transportiert werden alle als "Transportproteine" oder "Trägerproteine" bezeichnet. Vielleicht ist es nur meine Meinung als Laie, aber soweit ich das beurteilen kann, sind dies zwei deutlich unterschiedliche Prozesse. Ich sehe keine Logik darin, sie mit demselben Namen zu bezeichnen. Das eine ist ein Protein, das an eine Membran gebunden ist, das die Diffusion durch diese Membran erleichtert, und das andere ist ein Protein, das den größten Teil seiner Lebensdauer damit verbringt, Moleküle außerhalb der Domäne einer Zelle zu transportieren.

Ich frage mich, ob es vielleicht eine Reihe von Begriffen gibt, die zwischen den beiden unterscheiden?

Antworten (1)

Die kurze Antwort auf diese Frage lautet NEIN.

Um den Grund zu verstehen, muss man bestimmte Dinge über Proteine ​​und deren Erforschung schätzen. Ein Hauptziel der Erforschung von Proteinen ist es, zu verstehen, wie ihre Strukturen ihre Funktionsweise bestimmen, und nicht, sie nach ihrer Funktion zu klassifizieren. Natürlich ist es hilfreich, ähnliche Proteine ​​Gruppen zuzuordnen und sie mit Phrasen zu beschreiben, aber mit fortschreitender Wissenschaft können sich breite Kategorien als ungültig oder wenig hilfreich herausstellen, und selbst wenn sie gültig sind, kann es hilfreicher sein, engere Kategorien mit den Praktikern in Betracht zu ziehen sich des Gesamtbildes bewusst sein.

Ich habe für Studenten im Grundstudium Einführungsvorlesungen über Proteine ​​gehalten und würde einige der verschiedenen Rollen auflisten, die sie spielen können. Ich hätte vielleicht so etwas gesagt wie „einige katalysieren Reaktionen, manche spielen eine strukturelle Rolle, manche transportieren Substanzen durch Membranen, andere transportieren Moleküle von einem Ort zum anderen …“. Aus stilistischen Gründen habe ich zwei verschiedene Verben „transportieren“ und „tragen“ verwendet – und wenn ich Überschriften für eine Liste machen wollte, könnte ich „Trägerproteine“ und „Membrantransporter“ verwenden, aber das sind keine offiziellen Kategorien und andere könnten sie verwenden andere Beschreibungen.

Wie @bryankrause kommentierte, stellen „Trägertransportproteine“ wie Apolipoprotein, Albumin, Zinkträger, Hämoglobin usw. sehr unterschiedliche Typen dar und werden nach der ersten Einführung im Allgemeinen nicht zusammen betrachtet. Der Begriff „Trägerprotein“ ist problematisch, da er gedanklich mit „Acyl-Trägerprotein“ assoziiert werden kann.

Was die „Membrantransporter“ betrifft, so ist es aufschlussreich, sich den Index zu dem angesehenen Text Berg et al . Biochemie – Kapitel 13 , das solche Proteine ​​unter dem Titel „Membrankanäle und Pumpen“ behandelt. Dieser hat einen Untertitel „Viele Moleküle benötigen Proteintransporter, um Membranen zu durchqueren“, verwendet dann aber spezifische Begriffe für verschiedene Klassen wie „Ionenkanalproteine“, „Sekundärtransporter“, „Ionenpumpen“.

Zusammenfassend lässt sich sagen, dass sich Proteinforscher hauptsächlich auf beschreibende Ausdrücke und präzise Fachunterkategorien konzentrieren, wenn sie über funktionelle Gruppen sprechen. Der biologischen Taxonomie am nächsten kommen vielleicht strukturelle Klassifikationen wie SCOPe .