Kann jemand hoch verwandte Bakterien- oder Parasitenarten vorschlagen, die bei sehr unterschiedlichen Temperaturen leben, was ein gutes Modell für den Vergleich von Genomen in Bezug auf die Temperaturanpassung sein könnte? Zum Beispiel verwandte Krankheitserreger, von denen eine Art Warmblüter und die andere Kaltblüter infiziert? Bisher ist mir ein mögliches Beispiel eingefallen: Salmonella enterica ist ein Erreger, der warmblütige Tiere befällt, während Salmonella bongori hauptsächlich Reptilien befällt.
Beispiele, für die es öffentlich verfügbare Genome gibt und die in früheren Studien verwendet wurden, wären vorzuziehen.
Als Ausgangspunkt würde ich vorschlagen, dass Sie sich die Genome von Thermophilen und Hyperthermophilen (Organismen, die bei über 40 °C bzw. 60 °C gedeihen) ansehen, die häufig in der Nähe von Unterwasservulkanen oder heißen Quellen zu finden sind.
Beispielsweise könnte man eine Genomanalyse des archaischen Methanocaldococcus janaschii durchführen und ihn mit mesophilen Arten von Methanocaldococcus oder Methanococcus vergleichen . Dieser Organismus ist gut untersucht, und genomische Informationen für diesen Organismus sind leicht zugänglich .
Es wurden einige Studien durchgeführt, in denen die Genome von Mesophilen und Thermophilen verglichen wurden. Beispielsweise fanden Zheng und Wu (2010) eine Korrelation zwischen dem GC-Gehalt in codierenden/nicht codierenden Regionen und den Temperaturbedingungen.
Am anderen Ende des Spektrums könnten Sie Psychrophile (Organismen, die bei niedrigen Temperaturen wachsen, −20 °C bis +10 °C) untersuchen. Allerdings sind nur wenige dieser Organismen obligate Psychrophile, was bedeutet, dass viele auch bei höheren Temperaturen gedeihen können und daher möglicherweise nicht für Ihren Zweck geeignet sind.