Ich möchte herausfinden, welche Gene im menschlichen Genom möglicherweise komplementär zu einem Transkript sind, das als Antisense-Transkripthemmung wirken könnte? Werden cis-NATs (natürlich vorkommende Antisense-Transkripte) als unterschiedliche Transkripte angesehen und anders benannt oder haben sie denselben Namen wie das Sense-Transkript?
Wenn das Antisense-Transkript korrekt annotiert und in den Datenbanken vorhanden ist (ein sehr sehr großes Wenn), dann hat es einen anderen Namen. Zum Beispiel hat das Maus-Msx1-Antisense-Transkript die RefSeq- Zugangsnummer NR_027920, während das Sense-Transkript desselben Gens NM_010835 ist .
Im Allgemeinen hat jedes Transkript, das von einem gegebenen Locus transkribiert wird, eine andere Akzession. Dasselbe gilt für alternativ gespleißte Transkripte. Wenn ein bestimmtes Gen 4 AS-Transkripte hat, hat jedes dieser Transkripte einen anderen, einzigartigen Zugang. Das humane Insulinrezeptorgen hat zum Beispiel zwei proteincodierende Transkripte, jedes mit seiner eigenen Akzession: NM_000208 und NM_001079817 .
Sie könnten an einer aktuellen Analyse von cis-NATs in 10 Arten [1] und auch an NATsDB : Natural Antisense Transcripts DataBase [2] interessiert sein .