Wird der Poly(A)-Schwanz hinzugefügt, während die Transkription noch läuft?

Das habe ich bei Campbell gelesen

....Spleißen und Hinzufügen von Poly-A-Schwänzen können auch auftreten, während die Transkription noch im Gange ist.

Wie kann der Poly(A)-Schwanz hinzugefügt werden, während die Transkription noch läuft?

Spleißen ist co-transkriptionell, nicht Polyadenylierung. Möglicherweise haben Sie eine Klausel in der Anweisung verpasst: P
@WYSIWYG Die gesamte Aussage lautet: "In der Zelle wird die 5-Kappe kurz nach Beginn der Transkription hinzugefügt, Spleißen und Hinzufügen von Poly-A-Schwänzen können auch auftreten, während die Transkription noch im Gange ist."
Polyadenylierungssignale sind am Ende des Gens vorhanden. es ist also nicht möglich ... das bedeutet, dass dieses Lehrbuch falsch ist
@WYSIWYG Ja, das denke ich auch, aber es wäre besser, wenn wir warten würden, bis einige andere Leute antworten, da dieses Lehrbuch eine seriöse Quelle ist.
Das Lehrbuch enthält eine Referenz für diese Aussage. prüfe das.
@WYSIWYG Das Lehrbuch enthält überhaupt keine Referenzen ...
dann ist es ein schlechtes Lehrbuch :P
@WYSIWYG Wohoo!!
@WYSIWYG Wikipedia sagt: "Die Polyadenylierung tritt während und unmittelbar nach der Transkription von DNA in RNA auf."

Antworten (2)

Es ist etwas komplizierter als die obigen Kommentare andeuten.

Glover-Cutter, K et al. (2007) RNA-Polymerase II pausiert und assoziiert mit Prä-mRNA-Verarbeitungsfaktoren an beiden Enden von Genen. Nature Structural & Molecular Biology 15: 71-78

Die Autoren legen Beweise dafür vor, dass RNA polII 0,5–1,5 kb stromabwärts der Poly(A)-Stelle pausiert, wo Verarbeitungsfaktoren rekrutiert werden (Spaltungsstimulationsfaktor oder CstF und Spaltungspolyadenylierungsspezifitätsfaktor, CPSF). Die Polymerase ist also immer noch mit der Matrize und der premRNA beschäftigt, wenn die Prozessierung eingeleitet wird, obwohl sie das Transkript möglicherweise nicht aktiv verlängert.

"Die Lokalisierung des aktiven polII-3'-Endverarbeitungskomplexes weit stromabwärts der Poly(A)-Konsensussequenz stimmt gut mit der Spaltung von Chironomus BR1-Transkripten überein, nachdem 600 Basen der stromabwärts gelegenen Sequenz transkribiert wurden. Dieses Modell wird auch durch die Tatsache gestützt, dass eine effiziente Spaltung der Poly(A)-Stelle erfordert einen intakten RNA-Tether, der die Poly(A)-Stelle mit der nachgeschalteten Polymerase verbindet.“ ( Referenzen sind im Original zitiert ).

Es ist eine semantische Frage, ob Sie dies als kotranskriptionelle Verarbeitung bezeichnen.

[Übrigens ist dies ein weiteres Beispiel, das der allgemein verbreiteten Vorstellung widerspricht, dass die Evolution darauf abzielt, alles zu optimieren, um ATP zu erhalten – hier haben wir den Transkriptionsprozess, der die Energie von ungefähr 1000 Phosphodiesterbindungen pro Transkript verwirft .]

UPDATE @WYSIWYG Die Polymerase geht an der Stelle vorbei, an der das Poly(A) schließlich hinzugefügt wird, und stellt weitere 1000 RNA-Basen her, bevor sie pausiert, um Faktoren zu rekrutieren, die für die nachfolgende Spaltung an der Pol(A)-Stelle benötigt werden, die jetzt liegt " dahinter". Danach wird der Poly (A)-Schwanz am neu erstellten 3'-Ende hinzugefügt. Die Initiierung der Poly(A)-Addition (in dem Sinne, dass die Spaltung ein obligatorischer erster Schritt im Prozess ist) wird also erreicht, während die Polymerase noch involviert ist. Ich stimme zu, dass die tatsächliche Zugabe des Poly(A) in keiner Weise als cotranskriptionell betrachtet werden kann.

Ich habe versucht darauf hinzuweisen, dass es nicht einfach darum geht, dass die Polymerase auf die Spaltstelle trifft und abfällt, um einen zweiten nicht verknüpften Prozess zu ermöglichen.

Aber die Rekrutierung von CstF oder CPSF kann nicht als Ereignis einer Polyadenylierung betrachtet werden. Das Spleißen erfolgt tatsächlich co-transkriptionell, aber es ist theoretisch unmöglich, eine co-translationale Polyadenylierung für das akzeptierte unidirektionale Transkriptionsmodell zu haben. Außerdem, wie würde die Polymerase das PolyA-Signal 1,5 kb stromaufwärts erfassen, ohne es tatsächlich zu erfassen (oder sie benötigt einen Komplizen); Vielleicht geschieht die Zusammenstellung einfach als Ergebnis von Prozessen, die während des Transkriptionsstarts initiiert werden.
IMHO ist es immer noch falsch zu sagen, dass die Polyadenylierung während der Transkription stattfindet. Es ist gleichbedeutend mit der Aussage, dass der Eisprung seit der Kindheit einer Frau stattfindet.

Wie andere bereits gesagt haben, erfolgt das Spleißen zwar transkriptionell, aber Sie können die RNA nicht aktiv transkribieren, während sie transkribiert wird. Es ist jedoch allgemein anerkannt, dass ein Transkript polyadenyliert werden kann, während die RNA-Polymerase noch transkribiert – dies wird als Torpedomodell bezeichnet. Der Unterschied besteht darin, dass das Transkript zwischen der Polymerase und dem PolyA gespalten wurde, sie aber immer noch Teil desselben Transkriptionsereignisses waren. Siehe die Abbildung hier ... http://www.nature.com/nsmb/journal/v11/n12/fig_tab/nsmb1204-1156_F1.html

Wird der Poly(A)-Schwanz hinzugefügt, während die Transkription noch läuft?
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