Ich bin Statistiker und möchte meine neue Methode an biologischen Daten testen. Dazu suche ich Genotypdaten für eine Reihe von Personen. D.h. ich suche sowas:
| Person 1 | Person 2 | Person 3 | Person 4 | .... Chromosom 1 SNP 1 | AA | BA | AB | BB | Chromosom 1 SNP 2 | AB | AA | AB | BA | Chromosom 2 SNP 1 | BB | AB | BB | AB | usw.
Die Sorte ist mir ziemlich egal. Idealerweise hätte ich gerne Daten für komplexe und weniger komplexe Genotypen (unterschiedliche Anzahl von Chromosomen und Anzahl von SNPs).
Gibt es solche öffentlich zugänglichen Datensätze? Ich habe im Internet gesucht, aber ich kann nichts finden.
das ist der erklärte Zweck des Tausend-Genome-Projekts.
Das Tausend-Genome-Projekt hat ... 1000 Genome.
es ist alles herunterladbar.
Wie wäre es mit der Allelfrequenz-Datenbank?
http://alfred.med.yale.edu/alfred/index.asp
Eines der Hauptprobleme bei SNP-Datenbanken ist, dass es viele davon gibt, sodass Sie sich schnell verirren können. Diese Ansicht gibt einen Überblick über die verfügbaren Ressourcen:
http://www.humgen.nl/SNP_databases.html
Hoffe das hilft.
Im Populationsbiologie-Browser von VectorBase ist eine große Menge an Genotypdaten verfügbar , es ist eine Datenbank von Insekten, die sich gemäß vieler mathematischer Annahmen verhalten - zB die nicht überlappenden diskreten Generationen und die homogene Paarungslandschaft.