Warum haben fast alle SNPs zwei Allele?

Wenn ich die Wikipedia-Seite für SNPs lese, finde ich den Satz „ Fast alle gängigen SNPs haben nur zwei Allele. “ Dies stimmt mit der Terminologie an anderer Stelle überein, wie z im Allgemeinen nur zwei Allele für einen gegebenen SNP.

Aber es gibt 4 gemeinsame Nukleotide, A, T, C und G. Warum sollte es nicht üblich sein, 3 oder 4 Allele an einer bestimmten Stelle zu haben? Die einzige Möglichkeit, die mir möglich erscheint, besteht darin, dass der Strang ignoriert wird und somit an einer bestimmten Stelle "A" und "T" als dasselbe Allel und "C" und "G" als dasselbe Allel betrachtet werden. Ist das so oder verstehe ich da was falsch.

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Nun, obwohl es möglich ist, SNPs mit mehr als zwei Allelen zu haben, und einige existieren, aufgrund der geringen Wahrscheinlichkeit, dass sich ein Basenpaar zweimal im selben Basenpaar ändert (es gibt ungefähr 3.000 MB im menschlichen Genom) und es haben bei mehr als 1% der Bevölkerung (denken Sie daran, wir sprechen von Einzelnukleotid- Polymorphismus ) als Polymorphismus zu klassifizieren, ist ein sehr seltenes Phänomen.

Ich kann die Mathematik dafür überprüfen, wenn Sie es brauchen, aber es ist nur eine Frage der Wahrscheinlichkeit.

Um sicher zu sein, dass ich es verstehe, ist die Idee, dass sagen wir, 100% einer Bevölkerung haben an einigen Stellen zu einem bestimmten Zeitpunkt ein "A". Nehmen wir dann an, eine Mutation bewirkt, dass ein Mitglied der Bevölkerung, nennen Sie sie Alice, die Loci an dieser Basis durch ein "C" ersetzt, und sie geben diese Mutation an ihre Nachkommen weiter. Nach einiger Zeit würden diese Loci als SNP betrachtet, wenn genug von Alices Nachkommen überlebten, so dass sie 1 % der Bevölkerung ausmachen. Die einzige Möglichkeit für ein anderes Allel besteht darin, dass jemand anderes zu einem anderen Zeitpunkt AUCH eine Mutation an diesem Loci hat, die von "A" oder "C" abweicht, was selten ist
Der Prozentsatz variiert zwischen den Definitionen von Polymorphismen, einige sagen 1 %, andere sagen 5 %, aber Sie haben die Idee. Sie müssen denken, dass es sich nicht um einen Loci handelt, sondern um eine einzelne Position eines Loci. Selbst wenn alle Locis in jeder Generation 1 einzelne Basenmutation mit einer Länge von 2,5 kb (das ist der durchschnittliche Loci, wenn ich mich recht erinnere) angesammelt hätten, wäre es immer noch 1/2500 Wahrscheinlichkeit, den Aame-Buchstaben zu beeinflussen, und mal 2/3 (als einer der Mutationen wären eine Rückkehr zum Original). Also ja, es ist höchst unwahrscheinlich.
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