Kann DNA als Translationssubstrat fungieren?

Ich bekomme widersprüchliche Antworten. Man könnte meinen, wenn es wahr wäre, wäre es ziemlich bahnbrechend und weithin bekannt.

Es gibt Veröffentlichungen von Khorana [1] , Holland [2] und Bretscher [3] (Ende der 60er Jahre), die darauf hindeuten, dass es in Gegenwart von Antibiotika wie Neomycin ziemlich einfach ist.

Aber neuere Arbeiten wie diese [4] stellen immer noch offen die Frage, und das einzige, was wir wissen, ist, dass der anfängliche Ribosomenbindungsschritt zwischen RNA und DNA ähnlich ist.

Ich kann diese Papiere nicht abgleichen.

  1. Morgan AR, Wells RD, Khorana HG . 1967. Studies on polynucleotides. LXXIV. Direkte Translation in vitro von einzelsträngigen DNA-ähnlichen Polymeren mit sich wiederholenden Nukleotidsequenzen in Gegenwart von Neomycin B. Journal of Molecular Biology, 26(3):477-497, doi:1016.10/0022-2836(67)90316-6 .
  2. McCarthy BJ, Holland JJ . 1965. Denaturierte DNA als direkte Matrize für die In-vitro-Proteinsynthese. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 54(3):880-886.
  3. Bretscher MS . 1969. Ribosome Initiation and the Mode of Action of Neomycin in the Direct Translation of Single-Stranded fd DNA. Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology, 34:653-651, doi:10.1101/SQB.1969.034.01.075.
  4. Damiana L., Marty-Detravesa C., Winterhalterc M., Fourniera D., Paquereaua L. . 2009. Einzelstrang-DNA-Translationsinitiationsschritt, analysiert durch isotherme Titrationskalorimetrie. Biochemical and Biophysical Research Communications, 385(3): 296-301, doi:10.1016/j.bbrc.2009.05.044.
Aber der erste Satz des Abstracts des Papiers von 2009 sagt, dass es (noch) eine offene Frage ist und weist auf Diskrepanzen hin: Ist Einzelstrang-DNA translatierbar? Seit den 60er Jahren bleibt die Frage offen, ob DNA direkt in Protein übersetzt werden kann oder nicht. Einige Diskrepanzen in den Ergebnissen wurden über die funktionelle Translation von Einzelstrang-DNA berichtet, aber alle Ergebnisse konvergierten auf ein ähnliches Verhalten von RNA und ssDNA im Initiationsschritt. Dieses Papier betrachtete nur die Initiation und Bindung, es wurde kein Proteinprodukt AFAICT nachgewiesen. Ich denke, das ist es, worauf sie sich in Bezug auf ef beziehen

Antworten (1)

Soweit ich aus dem von Ihnen verlinkten Artikel (Damiana et al.) entnehmen kann, ist dies möglich, aber ineffizient:

Natürlich haben wir versucht, ssDNA zu translatieren, aber wie bereits an anderer Stelle beschrieben, war die direkte DNA-Translation in Abwesenheit von Antibiotika wie Neomycin [5] und [6] nicht wirklich effizient. Es schien, dass die Elongationsphase der limitierende Schritt bei der direkten Translation von einzelsträngiger DNA war. Ob die direkte Beteiligung der DNA an der Proteinsynthese in vivo irgendeine Rolle spielen könnte, muss ausgeschlossen werden, obwohl eine solche Rolle für die Modellierung der Evolution der frühesten Lebensformen attraktiv sein könnte.

Doch Damiana et al. immer noch sagen: "Ist einzelsträngige DNA übersetzbar?" „Mit diesen Experimenten wollten wir nicht testen, ob ssDNA als Translationsvorlage in Zellen verwendet werden kann oder nicht, aber …“ Mit „nicht wirklich effizient“ meinen sie, dass sie ihr beabsichtigtes Peptidprodukt nicht nachweisen konnten, was mehr scheint wie "nein, das geht nicht". „Bei allen früheren Arbeiten wurde getestet, ob ssDNA eine direkte Übersetzung erlaubt, aber die erzielten Ergebnisse waren nicht wirklich überzeugend, und die Möglichkeit, dass nur einige Schritte restriktiv sein könnten, wurde nicht überprüft.“
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