Angenommen, die gezeigte Sequenz wird von links nach rechts gelesen, was ist die Sequenz des produzierten Proteins?
Sequenz: 5'-ATGTACTTCCATCTGGAATAG-3'
MEIN VERSUCH: Ich weiß, dass RNA 5 zu 3 synthetisiert wird. Das bringt mich aus der Fassung, denn wenn wir die obige Sequenz von links nach rechts lesen, werden wir 3 zu 5 synthetisieren. Wenn ich das jetzt ignoriere, bekomme ich eine mRNA von 3'-UACAUGAAGGUAGACCUUAUC-5' daraus konnte ich leicht das Protein erhalten, indem ich mir ein mRNA-zu-Protein-Diagramm ansah. Ist das richtig?
Da die Sequenz mit einem Initiationscodon beginnt und mit einem Stoppcodon endet, kann ich davon ausgehen, dass dies der codierende Strang ist. Der codierende Strang hat die gleiche Sequenz wie die transkribierte RNA (außer T>U). Dies liegt daran, dass der andere Strang der DNA die Vorlage für die Synthese einer RNA ist. Die RNA ist zwar 5'>3' gemacht, aber die Vorlage, die sie verwendet, muss in die entgegengesetzte Richtung laufen.
5’-ATGTACTTCCATCTGGAATAG-3’
3'-TACATGAAGGTAGACCTTATC-5' template strand
5'-AUGUACUUCCAUCUGGAAUAG-3’ mRNA transcript
3'-TACATGAAGGTAGACCTTATC-5' template strand (read from left to right by the polymerase)
und die Sequenz des Proteins ist MetTyr ... etc
EMBOSS hat dafür ein Tool: http://www.ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_transeq/
Kirby
Alan Boyd