Kann ich anhand des Stammes herausfinden, welche Resistenz Bakterien haben? wo suche ich diese info?

Ich habe zum Beispiel eine Liste von Stämmen verschiedener Organismen:

Escherichia coli – ATCC 25922, CGSC 6152, W3110RL.

Pseudomonas aeruginosa – ATCC 27853, PAO1, APAE1111.

Ich kann keine Resistenzinformationen zu diesen Stämmen finden, z. B. welcher Stamm gegen welches Antibiotikum resistent oder anfällig ist. Gibt es eine Möglichkeit, das herauszufinden?

Danke.

Es gibt viele offizielle Websites, die Informationen und Sammlungen von mikrobiellen Stämmen enthalten, hier finden Sie eine Auswahl davon: ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4241729
@Dirigible Antworten sollten eher in Antworten als in Kommentaren enthalten sein.
@Dom, suchen Sie nach einer Datenbank mit Resistenzgenen, die von diesen Stämmen getragen werden, oder möchten Sie Informationen zu minimalen Hemmkonzentrationen?
Beginnen Sie mit den ATCC-Produktblättern (googeln Sie einfach die ATCC-Nummer). Sie haben viele Informationen über häufige Verwendungen, die Geschichte des Stammes, Referenzen und manchmal einige Informationen zur Empfindlichkeit gegenüber Antibiotika. Denken Sie daran, wenn es schon eine Weile in einem Labor herumschwirrt, sollten Sie vielleicht einige der MHK-Werte noch einmal überprüfen, da sie sich bekanntermaßen bei serieller Passage in Brühenkulturen ändern. Aber das ist meistens der Fall, wenn Sie ziemlich genaue Werte benötigen.

Antworten (1)

Wenn Datenbank- und Literaturrecherchen fehlschlagen, können Sie die GenBank-Zugangsnummern für Ihre Genome in den CARD Resistance Gene Identifier einfügen . Es braucht entweder Protein- oder Nukleotidsequenzen, obwohl Nukleotidsequenzen. zuerst ORF anrufen. Wenn Sie beispielsweise NZ_CP009072.1 für E. coli ATCC 25922 einfügen, erhalten Sie 7 perfekte Treffer für bekannte Antibiotikaresistenzgene. Zugegeben, das Tragen der genetischen Determinanten der Resistenz unterscheidet sich von der phänotypischen Resistenz, aber es ist ein Anfang.

Kann ich anhand des Stammes herausfinden, welche Resistenz Bakterien haben? wo suche ich diese info?
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