Kleine nichtkodierende RNA (sRNA) vs. Mikro-RNA (miRNA)?

Kleine nicht-kodierende RNAs werden im Allgemeinen NICHT als sRNA, sondern eher als sncRNA abgekürzt. Ich sage "wenn überhaupt", weil der "kleine" Teil subjektiv und nur eine Portmanteau-Beschreibung ist. Die direkte Antwort auf Ihre Frage ist, wie Forest geschrieben hat: miRNAs sind eine spezifische Art kleiner, nicht kodierender RNA, von denen einige bei der Regulation der Genexpression zu funktionieren scheinen – andere müssen noch charakterisiert werden. Ein weiteres Problem mit dem „kleinen“ Epitheton ist, dass miRNAs zwar nur 20 nt lang sein können, aber aus Prä-miRNAs von bis zu 1000 nt gebildet werden.

Andere Kategorien von kleinen nicht-kodierenden RNAs umfassen:

tRNA (Transfer-RNA) – ursprünglich abgekürzt sRNA (für lösliche RNA) – ist an der Proteinbiosynthese beteiligt.

5S rRNA - ein Bestandteil des Ribosoms

7SL-RNA – eine Komponente des Signalerkennungspartikels, das an der Erkennung des Signalpeptids von sekretierten und Membranproteinen beteiligt ist.

snoRNA (kleine nukleoläre RNA), von denen viele als Leit-RNAs bei der ribosomalen RNA-Modifikation fungieren.

snRNA (kleine Kern-RNA), von denen viele am Spleißom beteiligt sind, dem Ribonukleoprotein-Komplex, der Introns aus der Vorläufer-mRNA entfernt (diese haben Namen wie U1, U6 usw.)

SINE-RNA: RNA, die von den kurzen eingestreuten Kernwiederholungen (SINEs – Alu-Sequenzen beim Menschen) transkribiert wird, von denen angenommen wird, dass sie Pseudogene von 7SL-Signalerkennungspartikeln sind.

Und zweifellos gibt es einige, die ich (und die Wissenschaft) übersehen habe.

miRNA ist ein Mitglied der kleinen nicht-kodierenden RNA-Familie.

„Kleine nicht-kodierende“ ist ein ziemlich weit gefasster Begriff, der neben anderen regulatorischen RNA-Spezies auch microRNA und kurze interferierende RNA umfasst. Das Schlüsselwort ist „regulierend“; Jede Art von kleiner, nicht codierender RNA funktioniert, indem sie komplementäre Sequenzen bindet, um eine Art regulatorische Kontrolle über die Genexpression auszuüben. Jemand, der sich besser auskennt, könnte dies korrigieren oder ergänzen, aber ich glaube, dass ein entscheidender Unterschied zwischen den verschiedenen Arten von regulatorischer RNA davon abhängt, welche anderen Faktoren sie an ihren Wirkungsort rekrutieren.

Strukturelle Unterschiede zwischen diesen RNAs sind etwas schwieriger zu charakterisieren. Dieses Papier diskutiert zum Beispiel, wie gefunden wurde, dass miRNA widersprüchliche Rollen bei der Genregulation spielt; einige Gene unterdrücken, andere hochregulieren. Die genauen Mechanismen dahinter sind ein aktives Forschungsthema, aber vieles scheint, wie ich bereits erwähnt habe, davon abzuhängen, welche anderen Proteine ​​sie rekrutieren, und dies wiederum scheint unter anderem von Dingen wie Zelltyp und Entwicklungsstadium beeinflusst zu werden . Hier ist ein weiteres Papier , das auf einige der sequenzbasierten Strukturmerkmale von miRNA eingeht. Ich weiß, dass dieser kostenlos ist, aber der erste könnte hinter einer Paywall stehen. Wenn ja, kontaktieren Sie mich und ich kann Ihnen ein pdf senden.

Ich höre die Begriffe jedoch nicht synonym verwendet, zumindest nicht in dem Sinne, dass jemand "kleine nicht kodierende RNA" sagt, wenn er speziell über miRNA spricht.