Modularität von Transkriptionsfaktoren

Ich nahm an einem Seminar über Neurogenese teil, das Ergebnisse für PAX6 als einen wichtigen TF präsentierte, der 3 Domänen mit sehr unterschiedlichen Mustern der Downstream-Expression enthält. Der Redner sagte schließlich, dass PAX6 als 3 TFs in einem Protein betrachtet werden kann, die in verschiedenen Situationen unabhängig voneinander agieren:

Relative Rollen der verschiedenen Pax6-Domänen für die Entwicklung von Pankreas-Alphazellen

Kennt jemand weitere Beispiele dieser Art?

interessant - ich habe von "generischen" Transkriptionsfaktoren gehört, die über gemeinsame Sequenzmotive (z. B. die CCAAT-Enhancer-Bindungsproteine) auf viele Gene einwirken, aber nicht von Faktoren, die tatsächlich unterschiedliche Motive mit unterschiedlichen nachgeschalteten Effekten haben. Das interessiert mich auch.

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Die NF-κB- Familie von Transkriptionsfaktoren ist sehr modular aufgebaut, wobei verschiedene Kombinationen unterschiedliche Wirkungen haben. Der aktive (nukleäre, DNA-gebundene) TF ist ein Dimer, das unterschiedlich aus RelA/p65- , RelB- , c- rel- , NFKB1/p50- und/oder NFKB2/p52- Untereinheiten zusammengesetzt ist. Beispielsweise wird das „kanonische“ p65/p50-Dimer als Reaktion auf Stimulanzien wie TNF-α (Tumornekrosefaktor alpha, freigesetzt als Reaktion auf Entzündungssignale wie das Vorhandensein von Krankheitserregern) und LPS (Lipopolysaccharid aus den Zellwänden von Gram- negative Bakterien), während das RelB/p52-Dimer eine wichtige Rolle bei der Entwicklung von B-Zellen spielt(die Komponente des Immunsystems, die Antikörper produziert). Der Transkriptionsfaktor AP-1 ist ebenfalls heterodimer und enthält Proteine ​​aus den Familien Jun, Fos, JDP und ATF, und es gibt zahlreiche andere Beispiele für multimere Transkriptionsfaktorkomplexe. Dieser kürzlich erschienene Artikel in Nature Immunology (Haftungsausschluss: Ich war nicht an dieser Forschung beteiligt, aber mein altes Labor hat ähnliche Arbeiten durchgeführt) zeigt die DNA-sequenzspezifische Bindung durch verschiedene NF-κB-Dimere.

Polymerismus im Allgemeinen und Dimerismus im Besonderen sind ziemlich übliche Arten der Transkriptionsaktivierung und -regulation. Die große Anzahl von Möglichkeiten, auf denen eine relativ kleine Anzahl von Transkriptionsfaktoren kombiniert werden kann, ermöglicht die exquisite Kontrolle von Genen, die auf eine große Vielfalt von zellulären Situationen reagieren. Leider bedeutet dies auch, dass Mutationen in wichtigen gemeinsamen Komponenten zu Transformation, uneingeschränktem Wachstum und der Entstehung von Tumoren führen können.

Letztes Jahr wurde in Cell ein Artikel veröffentlicht, der gezeigt hat, dass sich das Bindungsmotiv eines Hox-Transkriptionsfaktors ändert, je nachdem, ob ein Cofaktor an Hox gebunden ist.

Slatteryet al. (2011) Cofaktorbindung ruft latente Unterschiede in der DNA-Bindungsspezifität zwischen Hox-Proteinen hervor . Zelle , 147 (6) 1270-1282. doi: 10.1016/j.cell.2011.10.053 ( pdf )