Gibt es eine Software, mit der die von Drosophila auf ein Substrat gelegten Eier schnell (schneller als Menschen) gezählt werden können , indem sie unter ein Mikroskop mit angeschlossener Kamera gelegt werden? Die Eier werden auf die Oberfläche des Futters gelegt und haben eine ziemlich einheitliche Form – wir müssen regelmäßig die Anzahl der Eier in >200 Fläschchen zählen, was über 4-5 Stunden pro 100 Fläschchen dauern kann.
Ich frage mich, ob es eine Software gibt, die mit einem Mikroskop mit montierter Kamera verbunden werden könnte, die mit einem Computer verbunden ist, die Software könnte dann aus dem Live-Feed oder einem schnell aufgenommenen Foto zählen. Es müsste nicht perfekt sein, aber solange es so genau wie Menschen sein könnte (was unserer Erfahrung nach überraschend niedrig ist - wir zählen bis zu einer bestimmten Menge und entfernen dann den Rest, z. B. wenn ich darauf abzielte, 180 Eier zu hinterlassen, I würde mich freuen, irgendwo zwischen 150-200 Eier zu bekommen). Es würde ein Stereomikroskop (auch bekannt als Seziermikroskop) mit einer montierten Kamera verwendet.
Die Oberfläche des Lebensmittels mit Eiern sieht ungefähr so aus -> rein zur Veranschaulichung, aufgenommen mit dem iPhone - echte Bilder auf dem Mikroskop könnten näher heranrücken (Lebensmitteloberfläche könnte den Bildschirm füllen) und eine gleichmäßigere Beleuchtung haben, um einen besseren Kontrast zu erzielen (dies war genommen, um in einem Vortrag zu zeigen, also wollte ich eher hübsch als praktisch). Die unteren zwei Viertel des Essens in diesem Bild wären dem tatsächlichen Ergebnis ähnlich, nur viel näher ...
ImageJ ist eine plattformübergreifende Software mit einem Zellzählermodul, das von Nutzen sein könnte, und hey, es ist kostenlos! Es ist einfach zu bedienen und so lächerlich grob, dass es sehr vielseitig ist. Ich erinnere mich, dass ich es im Grundstudium verwendet habe, um Zellen nach ein paar Bildkontraständerungen automatisch unter dem Mikroskop zu zählen. Ich verstehe nicht, warum dies nicht erneut angewendet werden konnte, um Eier zu zählen.
Herunterladen: http://rsb.info.nih.gov/ij/download.html
Cell Counter-Dokumentation: http://imagej.nih.gov/ij/plugins/cell-counter.html
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Michael Kühn