Ich bin auf eine Online-ppt-Folie des bioinformatischen Algorithmus gestoßen, in der gesagt wird, dass der erste und der letzte Aminosäure-Ramachandran-Winkel nicht erforderlich sind, um alle seine internen Koordinaten zu ermitteln. Braucht es wirklich keine Simulationen bei der Vorhersage der 3D-Struktur von Proteinen? Wenn wir beispielsweise eine Proteinkette mit einer N-Aminosäuresequenz haben, gibt es 2N Diederwinkel. Davon brauchen wir nur die 2N-2 (abgesehen vom ersten und letzten Aminosäure-Diederwinkel) Diederwinkel anzugeben. Warum werden die beiden Winkel ignoriert? Nehmen wir an, dass alle Bindungswinkel und Bindungslängen für die gesamte Kette bereitgestellt werden.
Ich habe diese Aussage in der folgenden ppt, Folie Nummer -9, betitelt Darstellung der internen Koordinaten, unter Punkt 3 gesehen.
Denken Sie an den Fall einer Kette von N=3 Punkten im Raum. Dem Mittelpunkt sind nur Winkel zugeordnet, den beiden Endpunkten sind keine Winkel zugeordnet, da sie nur ein einfallendes Segment und nicht zwei haben.
lästig