Was ist Immunpanning (im Vergleich zu Immunpräzipitation und FACS)?

Den Begriff hatte ich bis heute noch nie gehört. Soweit ich das beurteilen kann, werden Antikörper verwendet, um eine interessierende Zellpopulation zu reinigen. Ich würde mich über weitere Details freuen, insbesondere darüber, wie es sich von der "Immunpräzipitation" von Zellen über Zelloberflächenmarker und FACS unterscheidet.

Antworten (1)

Immunpanning ist im Wesentlichen eine Immunpräzipitation (IP) von Zellen unter Verwendung eines Antikörpers , der auf einer festen Oberfläche wie einer Zellkulturplatte immobilisiert ist. Herkömmlicherweise wird eine IP unter Verwendung kleiner Agarose- oder Magnetperlen (ca. 50 bis 150 μm groß) durchgeführt, die an einen Antikörper oder Protein A/G konjugiert sind , und kann einzelne Proteine, Proteinkomplexe und/oder Nukleinsäurekomplexe herunterziehen.

Zellen sind offensichtlich viel größer als Proteinkomplexe und zum größten Teil viel kleiner als Kügelchen, aber sie können während eines traditionellen IP beschädigt werden, daher verwendet Immunpanning eine einzelne feste Oberfläche, die mit dem spezifischen Antikörper oder Zelloberflächenproteinliganden der Wahl beschichtet ist . In diesem Artikel (kostenloses PDF hier ) wurde der retrograde axonale Transport verwendet, um spezifische Populationen von neuronalen Zellen selektiv mit dem extrazellulären Teil des Choleratoxins β (CTB) zu markieren, der an fluoreszierende Kügelchen adsorbiert wurde, dann wurden die Zellen unter Verwendung eines immobilisierten Anti-CTB-Antikörpers gereinigt .

Fluoreszenz-aktivierte Zellsortierung oder FACS ist eine weitere Möglichkeit, Zellpopulationen zu reinigen. Zellen werden mit einem fluoreszierenden Marker markiert (entweder konjugiert an einen Antikörper, der spezifisch für ein extrazelluläres Epitop ist, durch Absorption wie im obigen Beispiel oder durch Expression eines fluoreszierenden Transgens wie GFP ), dann in einem Durchflusszytometer gescannt. Zellen, die bestimmten Parametern oder "Toren" in der Software der Maschine entsprechen, werden dann in eine separate Sammelkammer umgeleitet, was die Erzeugung einer ziemlich reinen Zellpopulation ermöglicht.

Wie die Autoren jedoch in ihrem oben genannten Artikel betonen, erfordert FACS ein teures Gerät (kann über 100.000 US-Dollar betragen), kann hart für die Zellen sein und ist von der Verfügbarkeit eines Antikörpers gegen einen spezifischen Zelloberflächenmarker abhängig die gewünschte Zellpopulation. Immunpanning ist wesentlich kostengünstiger, schonender für die Zellen und im Fall der Autoren wirklich die einzige Möglichkeit, ihre interessierende Zellpopulation aufzureinigen, da keine spezifischen Biomarker zur Verfügung standen. Es wird FACS auf lange Sicht sicherlich nicht ersetzen, ist aber ein weiteres Werkzeug, das Forscher bei der Untersuchung bestimmter Zelltypen verwenden können.

Das Immunpanning ist also "sanfter" als die Immunpräzipitation, da eine flache Oberfläche anstelle von Kügelchen verwendet wird (und daher kein Zentrifugationsschritt zum Isolieren der Kügelchen erforderlich ist)?
@dd3 - richtig. Außerdem interagieren die Kügelchen im Röhrchen nicht physisch miteinander, was möglicherweise Zellen zerquetscht oder zerreißt. Eine Zelle könnte leicht fest an zwei Perlen gebunden werden, eine auf jeder Seite, und möglicherweise auseinandergerissen werden, wenn sie sich trennen. Es ist auch viel einfacher, an eine Platte gebundene Zellen zu entfernen, als die Zellen nach den Waschschritten von den Kügelchen zu trennen.
Vielen Dank. Ich habe noch nie etwas davon gemacht (lesen Sie nur, dass sie in Zeitungen verwendet werden), daher waren alle Ihre Links sehr hilfreich.
@dd3 - überhaupt kein Problem, ich bin hier, um zu helfen. Danke, dass Sie es überprüft haben!