Von zwei der Proteine, die ich erforsche, ist bekannt, dass sie interagieren. Ich würde jedoch gerne wissen, ob sie auch mit anderen Proteinen interagieren und möglicherweise einen Signalweg bilden. Welche Analysetechnik(en) sollte ich verwenden, um dies zu bestimmen, wenn ich bereits eine All- in-silico -Analyse durchgeführt habe? Jeder Vorschlag ist willkommen.
Ich verwende in meiner Forschung einen Fadenwurm C. elegans , und RNAi ist keine Option, da ich es bereits durchgeführt habe.
Es gibt viele Methoden zu verwenden. Hier ist ein Überblick und Hintergrund einiger gängiger Methoden, wie sie von ThermoFisher geschrieben wurden:
Es gibt auch Phagen-Display, wenn Sie Bindungspartner finden möchten, was eine sehr interessante Methode ist, um Bindungspartner aus einem ganzen Interaktom einzugrenzen. Es ist einfach in einem Labor einzurichten, und Sie können alles in einer 96-Well-Platte mit ELISA und mehreren Phagenselektionsrunden durchführen. Und natürlich gibt es auch zB Hefe-2-Hybrid (Y2H) oder Co-Immunopräzipitation (Co-IP).
MattDMo
Your questions should be reasonably scoped. If you can imagine an entire book that answers your question, you’re asking too much.Das Feld der Protein-Protein-Wechselwirkungen ist ziemlich breit, und es gibt zahlreiche Techniken, die berücksichtigt werden müssen. Es ist hier nicht der Ort, sie alle aufzuzählen.