Wenn Sie sich nur ein unbeschriftetes Bild ansehen, woher wissen Sie, dass es sich um ein Protein handelt?

Ich lerne etwas über Proteine ​​und muss dieses Konzept verstehen. Was macht diese bunte Schnörkelkugel identifizierbar? Warum ist es ein Protein und kein anderes Biomolekül (wie zum Beispiel DNA)? Was zeigen die Farben? Was sind die Variationen in der Form des Bildes?

Grundsätzlich stellt sich die Frage: Was will mir dieses Bild über dieses Protein sagen?

Ich weiß, dass dies ein Protein ist, aber nicht warum.

Diese Frage ist unklar. Fragst du "Was ist dieses Protein?" oder "Was an dieser Struktur macht es zu einem Protein?"
DNA ist eine Doppelhelix. Dies ist offensichtlich nicht der Fall.
Ich bin versucht, auch "Erfahrung" zu sagen - für mich ist das zum Beispiel eindeutig eine TIM-Fassfalte ...
@MattDMo DNA war mein zusätzliches Beispiel. Ich denke, OP wollte etwas in der Art wissen: "Wie erkennen die Leute das sofort als Protein und nicht als irgendein anderes Biomolekül?"

Antworten (2)

Formen

Dies ist eine gängige Art, ein Protein zu veranschaulichen und wird oft als "Protein-Cartoon" bezeichnet. Es gibt andere gängige Möglichkeiten, Proteine ​​zu veranschaulichen.

Dieser Cartoon zeigt Ihnen, wo sich α-Helices (Spiralen) und wo β-Faltblätter (Pfeile) befinden, die wichtige Strukturelemente sind. Die Saiten, die diese Strukturelemente verbinden, sind flexible "Schleifen"-Regionen.

Wenn Sie dies mit anderen Strukturen vergleichen und sehen möchten, um welches Protein es sich handelt, sehen Sie sich PhyreStorm an. Sie benötigen die PDB-Datei, nicht nur ein Bild.

Farbe

Auch die Färbung ist üblich. Der N-Terminus (die erste Aminosäure) ist blau gefärbt, und die Farben gehen durch den Regenbogen zum Rot, dem C-Terminus (der letzten Aminosäure in der Polypeptidkette).

Obwohl diese Frage beantwortet (und die Antwort akzeptiert) wurde, möchte ich etwas zur wissenschaftlichen Sprache und Konvention hinzufügen.

Sprache im Allgemeinen ist ein Kommunikationsmittel, das es Menschen ermöglicht, Ideen auszutauschen, die sie in ihrem Kopf haben. Die wissenschaftliche Sprache wird verwendet, um wissenschaftliches Wissen zwischen Menschen zu teilen, und neben der mündlichen und schriftlichen Kommunikation verwendet sie auch Zeichnungen aller Art, um komplexe Ideen besser zu veranschaulichen, die normalerweise mit bloßem Auge nicht sichtbar sind (ob wir über Moleküle in der Chemie sprechen, biologisch Mikrosysteme in der Biologie, Kräfte in der Physik usw.).

Das fragliche Bild stellt die herkömmliche Art der Darstellung einer Proteinstruktur dar, und diese weithin akzeptierte Konvention ist durch bestimmte Farben und Formen gekennzeichnet, wie in der obigen Antwort angegeben. Ich stelle mir vor, dass jemand, der diese Art von Darstellung zum ersten Mal sieht, nicht sofort weiß, dass dies eine Computerwiedergabe eines Proteins ist, weil niemand weiß, wie ein einzelnes Protein aussieht, bevor er es tatsächlich untersucht hat. Aber sobald Ihnen gesagt wird, dass es sich um eine Repräsentation eines Proteins handelt, akzeptieren Sie es und " markieren " es in Ihrem Kopf, sodass Sie beim nächsten Mal, wenn Sie es sehen, bereits wissen, wie ein Protein aussehen "sollte".

Und je mehr Sie sie studieren, desto selbstverständlicher wird diese Sprache für Sie.

Sie weisen Studenten der Naturwissenschaften auf etwas sehr Wichtiges hin, das sie verstehen müssen - das meiste, was wir im Unterricht lernen, ist nicht das Studium des Fachs, sondern eher die herkömmlich akzeptierten Sprachen und Darstellungsweisen, die von der wissenschaftlichen Gemeinschaft verwendet werden, um über die Themen zu sprechen und Informationen vermitteln.
Wenn Sie sich nur ein unbeschriftetes Bild ansehen, woher wissen Sie, dass es sich um ein Protein handelt?
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