Werden Enhancer und Silencer als epigenetische Modifikationen betrachtet? Ich bin verwirrt, da es so aussieht, als wären Enhancer und Silencer Sequenzen auf der DNA und wie sie funktionieren, ist die Bindung an Proteine, während epigenetische Veränderungen Änderungen an den Basen zu sein scheinen, zum Beispiel das Hinzufügen einer Methylgruppe.
NEIN.
Epigenetische Informationen sind (per Definition) NICHT in der Nukleotidsequenz enthalten, beeinflussen aber die genetische Expression.
Enhancer/Silencer sind selbst Nukleotidsequenzen und daher keine epigenetischen Informationen.
Methylierung ist ein Beispiel für epigenetische Information, aber eine DNA-Sequenz selbst ist genetische Information, auch wenn sie ein Gen betrifft.
CgATgCCAg= Genetisch
Acetylierung eines Histons/DNA-Methylierung = epigenetisch
Hoffentlich hilft das!
Weiterführende Literatur: http://www.whatisepigenetics.com/fundamentals/
Streng genommen sind Enhancer und Silencer selbst keine epigenetischen Modifikationen. Vielmehr sind sie genetische Elemente, die durch ihre Wechselwirkungen mit verschiedenen Proteinen direkt die Genexpression regulieren.
Eine epigenetische Modifikation ist eine chemische Veränderung an DNA-Basen, im Allgemeinen entweder durch Methylierung oder Acetylierung.
Enhancer- und Silencer-Sequenzen können und werden häufig durch Hinzufügen oder Entfernen dieser chemischen Gruppen epigenetisch verändert. Dies ist im Laufe der Entwicklung bei vielen Genen nicht ungewöhnlich , deren Expression in verschiedenen Entwicklungsstadien unterschiedlich reguliert werden muss. Enhancer und Silencer werden auch in verschiedenen Zelltypen epigenetisch reguliert , was es Zellen ermöglicht, dieselben Gene zu verwenden, die in jeder Zelle vorkommen, um unterschiedliche Zelltypidentitäten aufrechtzuerhalten.
Kurz gesagt, Enhancer und Silencer sind genetische regulatorische Elemente, aber sie sind sehr oft epigenetisch modifiziert. Hoffentlich hilft das.
Wir haben also bestimmte Kombinationen von Markierungen gefunden, die dazu neigen , DNA-Regionen zu markieren, die die Expression von Reportergenen verstärken/stilllegen, wenn wir sie in Plasmide stecken und Reportergenexperimente durchführen. Menschen definieren oft Regionen und nennen sie „Enhancer“, indem sie allein diese biochemischen Markierungen verwenden, aber es ist eine Annäherung. Es gibt keine Garantie dafür, dass alle diese Regionen Enhancer/Silencer sind, und es gibt sicherlich keine Garantie dafür, dass alle Enhancer/Silencer die Markierungen haben.
Epigenetik ist definiert als vererbbare Veränderungen der Genaktivität und -expression, die ohne Veränderung der DNA-Sequenz (nicht in der Sequenz codiert) auftreten und durch chemische Modifikation der DNA wie im Fall der Methylierung beeinflusst werden. Enhancer und Silencer sind DNA-Sequenzen, wie Gene, aber sie kodieren nicht für Proteine, sondern haben genregulatorische Wirkungen. Ein Enhancer/Silencer kann methyliert und damit epigenetisch kontrolliert werden.
James
Dio
James
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