Wie bleiben CpG-Inseln unmethyliert?

In den meisten Genomen sind CpG-Stellen so ziemlich immer methyliert, aber CpG-Inseln sind stattdessen oft unmethyliert. Dies wurde mit der Tatsache in Verbindung gebracht, dass sie oft mit transkribierten Genen assoziiert sind.

Was sind die aktuellen Theorien zu den Mechanismen, die an dieser bevorzugten Demethylierung beteiligt sind?

Antworten (1)

Methylierung wird zunehmend als Folge der Genaktivität und nicht als Regulationsmechanismus angesehen. Es gibt Fälle, in denen die Methylierung aufgrund der genregulatorischen Kontrolle kontrolliert wird, insbesondere am berühmten H19/Igf2-Lokus [ 1 ] . Hier ist eine allgemein gute aktuelle Übersicht [ 2 ] , beachten Sie, dass sie erwähnen, dass DNA-Methylierung kein transkriptionelles Silencing verursacht, und wahrscheinlich sind methylierte Promotoren wahrscheinlich aktiver als unmethylierte, sie erzeugen nur stummschaltende RNAs, wenn sie methyliert sind (was zu einem offensichtlichen Silencing führt). Dies kann helfen, einen Teil der Geschichte zu erklären [ 3 ], aber beachten Sie, wie alt dieses Papier ist, aber im Allgemeinen würde ich sagen, dass nur wenige Leute von seiner Existenz wissen.

Die Ausnahme scheinen transponierbare Elemente zu sein [ 4 ] , aber ihre Kontrolle wird wahrscheinlich auch durch Silencing-RNAs kontrolliert.

Verweise:

  1. M. Zampieri, T. Guastafierro, R. Calabrese, F. Ciccarone, MG Bacalini, A. Reale, M. Perilli, C. Passananti, P. Caiafa . 2012. ADP-Ribose-Polymere, die auf dem Ctcf-Parp1-Dnmt1-Komplex lokalisiert sind, verhindern die Methylierung von Ctcf-Zielstellen. The Biochemical Journal 441: 645–52.

  2. Deaton AM, Vogel A . 2011. CpG-Inseln und die Regulierung der Transkription. Gene & Entwicklung 25: 1010–22.

  3. Rountree MR, Selker EU . 1997. DNA-Methylierung hemmt die Verlängerung, aber nicht die Initiation der Transkription in Neurospora crassa. Gene & Entwicklung 11: 2383–2395.

  4. Bourc'his D, Bestor TH . 2004. Meiotische Katastrophe und Retrotransposon-Reaktivierung in männlichen Keimzellen ohne Dnmt3L. Natur 431: 96–9.

Dies kam vor wenigen Stunden heraus ( plosgenetics.org/article/… ). Das Imprinting des mütterlichen SNRPN-Allels (das nicht methyliert ist) erfordert eine Transkription, was wiederum unterstreicht, dass die Methylierung eher eine Folge der transkriptionellen Stummschaltung ist als ursächlich für die Gen-Stummschaltung.