Wie interpretiere ich diese Grafik in Bezug auf eingeführte Gene und virusinfizierte Zellen?

Plus und Minus beschreiben, was an einer bestimmten Stelle im Genom passiert. Wenn ein +-Zeichen angezeigt wird, enthält der Locus das natürliche, voll funktionsfähige Gen (Wildtyp). Wenn ein - angezeigt wird, bedeutet dies, dass Zellen durch natürliche Mutation oder Labormanipulation dieses natürliche Gen fehlen oder eine vernachlässigbare Menge davon herstellen oder eine defekte Variante herstellen usw.

Diese Zellen sind diplod, was bedeutet, dass sie zwei homologe Chromosomen haben. Wenn +/+ angezeigt wird, tragen beide Chromosomen an diesem Ort ein funktionierendes Gen. Wenn -/- angezeigt wird, funktionieren beide Kopien nicht. Wenn eine Zelle CatL -/- ist, fehlen beide natürlichen Kopien von CatL oder sind defekt, und die Zelle ist nicht in der Lage, das entsprechende Protein herzustellen. Die Manipulation, durch die ein natürlich vorkommendes +/+ in ein fehlerhaftes -/- umgewandelt wird, wird als Knock-out bezeichnet.

Der obere Teil Ihres Diagramms zeigt, was im Kern passiert, auf den Chromosomen, an den tatsächlichen Stellen, an denen normale Zellen ihre CatL-Gene speichern. Sie geben nicht viele Details an, aber der untere Teil des Diagramms scheint eine Manipulation vom normalen Ort weg zu zeigen. Es gibt Möglichkeiten, mehr Kopien einzuführen, sie in den Kern oder sogar in Chromosomen usw. einzufügen, aber der Hauptpunkt beim Einführen von DNA ist, dass es oft nicht so gut funktioniert wie das Natürliche.

Optimale Infektion bedeutet etwas in der Nähe der ersten Spalte, etwa 25 %. Wenn wir das Diagramm überfliegen, sehen wir definitiv eine gute Infektion in Spalte 3. Auch im Vergleich mit den niedrigen Niveaus könnten wir die Infektion in Spalte 8 als akzeptabel bezeichnen. Die anderen Spalten sind alle klare Fehler bei der Infektion.

Die zweite Spalte ist am einfachsten zu interpretieren: CatB allein ausschalten, und die Infektion ist weg. Daher wird CatB für eine Infektion benötigt. Die dritte Spalte verstärkt den gleichen Punkt: CatB wiederherstellen und die Infektion ist wieder normal.

Die sechste Spalte zeigt Zellen, in denen CatL und CatB ausgeschaltet wurden, aber dann CatB wieder eingeführt wurde. Wir wissen aus Spalte 3, dass das Ausschalten und Wiederherstellen von CatB die Infektiosität aufrechterhalten sollte, aber in Spalte 6 ist die Infektion verschwunden. Der einzige Unterschied zwischen den Spalten 3 und 6 ist der Knockout von CatL, und seine Folge ist das Fehlen einer Infektion. Somit wird auch CatL für eine Infektion benötigt. Sie können sagen, dass sowohl CatL als auch CatB erforderlich sind .

Die anderen Spalten sind Kontrollbedingungen, die zeigen, dass das Experiment gut konzipiert war und die erwarteten Ergebnisse und kein Kauderwelsch lieferte. Beispielsweise zeigt Spalte 5, dass die Infektion verschwunden ist, wenn Sie beide ausschalten. Es wäre sehr besorgniserregend gewesen, wenn es nicht weg gewesen wäre. Usw.

Ihre zweite Frage ist wirklich logisch: Reicht CatL aus? Wir haben festgestellt, dass CatB erforderlich ist, und daher gibt es wenig, was CatL tun könnte, um seine Abwesenheit zu ersetzen. Daher sollte CatL logischerweise nicht ausreichen .

Aber wir haben einen besseren Beweis aus den Experimenten. In Spalte 4 haben diese Zellen ihre natürliche (endogene) CatL, gekrönt von etwas mehr CatL. Aber sie sind immer noch nicht infiziert, weil ihnen CatB fehlt. Daher kann CatL, selbst in überlebensgroßen Mengen, das Fehlen von CatB nicht kompensieren. CatL ist nicht ausreichend .