Humane endogene Retroviren

Ich lese dieses Papier , das zeigt, dass ein humanes endogenes Retrovirus (HERV) K-Provirus an der orthologen Position von Gorilla- und Schimpansengenomen vorhanden ist, aber im menschlichen Genom fehlt.

Wenn es nicht im menschlichen Genom vorhanden ist, warum wird es dann immer noch als HERV bezeichnet? Sollte es sich nicht einfach um ein endogenes Retrovirus handeln?

(Ich bin kein Biologiestudent, daher habe ich die Idee eines Provirus/Retrovirus möglicherweise nicht ganz verstanden.)

Antworten (1)

Zunächst einmal ist das HERV-K-Virus im menschlichen Genom vorhanden, tatsächlich ist es dort eines der häufigsten endogenen Retroviren (siehe Referenzen 1 und 2).

Bei einer Virusinfektion werden diese Proviren in das menschliche Genom integriert und sind später dort zu finden. Dies ist ein nützliches Werkzeug, wenn Sie Details über die Aufteilung eng verwandter Arten wie Menschenaffen und Menschen herausfinden möchten. Findet man bei allen analysierten Arten ein solches Provirus, muss die Integration spätestens beim letzten gemeinsamen Vorfahren stattgefunden haben. Wenn es nur in einem Teil von ihnen gefunden wird, geschah dies nach der Teilung der Arten. Die Abbildung (aus Referenz 3) zeigt dies schematisch:

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Die Autoren "Ihres" Artikels haben dies getan und die Integration des Retrovirus an einem bestimmten Ort im Genom von Gorilla, Schimpanse und Mensch festgestellt und nur in den ersten beiden gefunden. Daraus schließen sie, dass die Affen untereinander näher verwandt sind als mit dem Menschen.

Zusammenfassend bedeutet dies also, dass das HERV-K nicht an einer bestimmten Stelle des menschlichen Genoms vorhanden ist, nicht im Allgemeinen.

Verweise:

  1. HERV-K: die biologisch aktivste humane endogene Retrovirus-Familie.
  2. HERV-K (HML-2), die am besten erhaltene Familie von HERVs: Endogenisierung, Expression und Auswirkungen auf Gesundheit und Krankheit
  3. Unterschiede in HERV-K-LTR-Insertionen in orthologen Loci von Menschen und Menschenaffen.
Humane endogene Retroviren
AntwortenHierDatenschutz-Bestimmungen1y, 0v