Bestimmung der Oligoribonukleotidsequenz

Oligoribonukleotid X wurde mit Phosphatase (zur Entfernung von 3'- und 5'-terminalen Phosphaten) behandelt, dann mit RNAase T1, die alle Phosphodiesterbindungen, die sich in einer 3'-Position von Guanosin befinden, auf 5'-spezifische Weise spaltet.Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Als Ergebnis wurden die Oligonukleotide L, M und N in gleichen Mengen erzeugt. Jeder von ihnen wurde weiter mit Phosphatase behandelt und einer alkalischen Hydrolyse unterzogen. Die Ergebnisse sind in der nachstehenden Tabelle aufgeführt.

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Dann wurde das Experiment modifiziert: Oligoribonukleotid X wurde nach Behandlung mit Phosphatase mit RNAaseP hydrolysiert, die alle Phosphodiesterbindungen in einer 3'-Position von Pyrimidinen in einer 5'-spezifischen Weise spaltet.

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Diese Hydrolyse ergab fünf Produkte in etwa äquimolaren Konzentrationen: Uridinmonophosphat, Cytidinmonophosphat und die Oligonukleotide P, Q und R. Nach Auflösung des Gemisches und alkalischer Hydrolyse dieser Oligonukleotide wurden die in der nachstehenden Tabelle aufgeführten Daten erhalten.

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Mein Gedanke: G kann nicht am 5'-Ende stehen, sonst würden wir auch im ersten Experiment ein einzelnes Guanosin bekommen. G kann auch nicht das vorletzte vom 3'-Ende sein, da wir keine Singles haben. Wir haben A und C in einer Dublette, also müssen sie am 3'-Ende gewesen sein.

Ich habe auch Probleme, die Bedeutung von "Mol / Mol Oligoribonukleotid" zu verstehen.

Ich versuche, andere Ergebnisse einzufügen, kann dies jedoch nicht. EIN GUTER TIPP WIRD MEHR GESCHÄTZT WERDEN ALS EINE DIREKTE ANTWORT.

Danke

@Satwik Meinst du im obigen Kommentar UMP und CMP?
@SatwikPasani Und mit Doublet meinst du nicht, dass sie 1 nach dem anderen sind, weil ich das nicht für möglich halte.
@biogirl Aus dem, was Sie bisher geschrieben haben, geht nicht hervor, dass Sie die Bedeutung erkennen, ein Cytidin anstelle eines CMP in einem der Produkte zu erhalten - es bedeutet beispielsweise, dass Sie die Sequenz von M ableiten können, was es Ihnen wiederum ermöglicht um die Folge von Q abzuleiten.
@biogirl Hast du das gelöst? Wenn ja, wollte ich die Antwort wissen, die sie (die Quelle der Frage) geben, um sicherzustellen, dass ich die richtige Lösung habe.
@SatwikPasani Ich habe diese Frage nicht noch einmal versucht, da ich mit anderen Dingen beschäftigt war. Werde um eure Hilfe bitten, falls ich es immer noch nicht schaffe. Die Antwort auf diese Frage wurde in der Quelle nicht gegeben. Danke.
@satwik pasani Nein! Ich bin nicht in der Lage, es zu lösen. Bitte sagen Sie mir die Antwort (nicht die Lösung, da ich sie "umgekehrt ableiten" möchte!)
@biogirl Ich hatte meine ursprüngliche Ableitung vergessen, aber ich habe sie schnell neu abgeleitet. Bitte überprüfen Sie, ob ich in Eile Fehler gemacht habe. 5 ' − U A C G C C G A C − 3 '
@SatwikPasani Vielen Dank: Ich werde es "umgekehrt ableiten"
@SatwikPasani ok ich habe es geschafft. Es ist richtig. Danke vielmals !

Antworten (1)

Hier sind ein paar Tipps, die Ihnen helfen könnten:

1) Sie erhalten frei UMPund CMP(im Gegensatz zu UMP + Coder CMP + U) im zweiten Versuch eine alkalische Hydrolyse vor.

2) Es gibt zwei CMPin "N" Oligoribonukleotide und ein freies Cytidin (und nicht CMP) in "M" und "Q".

3) Nutzung der Tatsache, dass alle Oligoribonukleotide mit Phosphatase behandelt wurden, bevor sie einer alkalischen Hydrolyse unterzogen wurden.

(In Bezug auf Ihren Kommentar weiß ich nicht, warum Sie denken, dass konsekutives Cytidin nicht möglich ist).

Dies sind einige Hinweise, die mir bei der Lösung geholfen haben. Wenn Sie weitere Erläuterungen oder die Antwort wünschen, teilen Sie mir dies in den Kommentaren mit.

Antwort für die umgekehrte Ableitung: - 5 ' − U A C G C C G A C − 3 '

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