Es gibt eine umfangreiche Literatur über synonyme Codons und ihre Verwendung in verschiedenen Organismen. Ich gehe davon aus, dass die Frage die Beziehung zwischen der Stärke der Codon-Anticodon-Wechselwirkung und der Effizienz (in diesem Fall der Geschwindigkeit) der Translation betrifft.
- Es wird nicht bestritten (mir sind wenige Experimente dazu bekannt), dass die Stärke der Codon-Anticodon-Wechselwirkung von der Anzahl der gebildeten Wasserstoffbrücken abhängt.
- Es wurde vorhergesagt, dass man für eine optimale Translationsgeschwindigkeit ein Gleichgewicht zwischen Assoziation und Dissoziation des Codon-Anticodon-Paares benötigt. Daher würden schwache Wechselwirkungen (alle AU) – die die Assoziation benachteiligen würden – oder starke Wechselwirkungen (alle GC) – die die Dissoziation benachteiligen würden – keine so schnelle Proteinsyntheserate ermöglichen wie die für intermediäre Wechselwirkungen (gemischte AU, GC).
- Dies schien sich in den Codon - Verwendungsmustern schnell wachsender Organismen wie Escherichia coli zu bestätigen , was später durch umfangreichere Studien bestätigt wurde . Um genau zu sein, wurden die stärker exprimierten Proteine (z. B. ribosomale Proteine) von mRNAs kodiert, die die intermediären Codon-Anticodon-Wechselwirkungen enthielten, von denen vorhergesagt wurde, dass sie eine schnelle Translation ermöglichen. Im Gegensatz dazu wurden schwach exprimierte Proteine (z. B. Repressoren) von meinen mRNAs kodiert, von denen vorhergesagt wurde, dass sie eine langsamere Translation erzeugen.
- Man sollte sich jedoch darüber im Klaren sein, dass es andere Faktoren gibt, die den Codon -Verbrauch in verschiedenen Organismen beeinflussen, und dass diese den Effekt der Codon-Anticodon-Wechselwirkungsstärke außer Kraft setzen können.
David
David