Wie lange dauert die Bildung einer Peptidbindung?

Wie lange dauert es, eine Peptidbindung in vivo oder in vitro zu bilden ? Es wird in meinem Kurs über Proteinstrukturen nicht erwähnt. Ich wollte nur wissen, ob eine Zeitskala bekannt ist?

Besteht angesichts der Tatsache, dass prokaryotische und eukaryotische Zellen unterschiedliche Ribosomenstrukturen haben, die Möglichkeit, dass die Zeit zwischen den Arten oder sogar innerhalb der Arten variiert?

Interessieren Sie sich für die Rate des ribosomalen Einbaus von Aminosäuren in ein wachsendes Polypeptid?
Kanadier: Ja. können wir ohne jeden Zweifel sagen, dass „die Zeit, die benötigt wird, um 2 beliebige Aminosäuren zu verknüpfen, immer gleich ist“ ???
@smileandbegin Ich würde mir vorstellen, dass es stark von den Cytosolkonzentrationen der tRNA-gebundenen Aminosäuren abhängt. Ich bin mir nicht sicher, wie die Beziehung zwischen tRNA-gebundenen Aminosäuren und ungebundenen Blut-/Cytosol-Aminosäuren ist, aber ich würde mir vorstellen, dass sie bis zu einem gewissen Grad proportional sind. Das bedeutet, dass die Zeit zur Bildung einer Bindung zwischen zwei beliebigen Aminosäuren je nach Ernährung, Stoffwechsel und möglicherweise Zelltyp variieren würde.

Antworten (1)

Alberts et al., Molecular Biology of the Cell , sagen, dass eukaryotische Ribosomen etwa 2 Aminosäuren pro Sekunde hinzufügen und Bakterien etwa 20 pro Sekunde (5. Auflage, S. 275). Diese sollten nur als ungefähre Schätzungen betrachtet werden: Die Rate wird sicherlich von Spezies zu Spezies, von Zelle zu Zelle, von Protein zu Protein variieren. Einige Zellen (z. B. Retikulozyten) sind professionelle Protein-Synthesizer. Andere, zum Beispiel bakterielle Endosporen, betreiben fast gar keine Proteinsynthese.

Diese Autoren schätzen die Translationsrate in embryonalen Stammzellen der Maus auf etwa 5,5 Aminosäuren/Sekunde. Es gibt viele Variationen von Gen zu Gen, sogar innerhalb dieses einen Zelltyps. Sie sehen sogar systematische Variationen, je nachdem, wo Sie sich im Gen befinden.

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