Epistase über Chromosomen hinweg und Individuen „homozygot für Interaktionen“

Entschuldigung für etwaige Fehler in der Nomenklatur. Ich bin Mathematiker und mache für eine Masterarbeit einen Ausflug in die Genetik. Insbesondere generiere ich künstliche diploide genetische Sequenzdaten und Phänotypdaten auf der Grundlage bekannter epistatischer Wechselwirkungen.

Hauptfrage

Ich bin mit dem Konzept vertraut, dass mehrere Kopien eines einzelnen Allels (z. B. eine von jedem Elternteil) tatsächlich die Expression erhöhen und dadurch den quantitativen Phänotyp verändern können (zumindest in einigen Fällen?). Kann das auch bei epistatischen Effekten passieren? Betrachten Sie zum Beispiel den Fall, dass Locus 1 ( L 1 ) und Lokus 2 ( L 2 ) weisen eine gewisse positive Wechselwirkung auf ( β ) auf die Eigenschaft ( Y ).

E [ Y ] = μ + β ( L 1 L 2 )
Wenn beide Chromosomen das fragliche Allel an beiden Loci enthalten, weist dieses Individuum dann eine stärkere Merkmalszunahme auf, als wenn es nur ein Chromosom mit den epistatischen Allelen hätte?

Sekundäre Frage

Können Allele epistatisch interagieren, auch wenn sie auf verschiedenen Chromosomen vorhanden sind? Angenommen, Allel A an Locus 1 interagiert mit Allel B an Locus 2. Individuum hat A an Locus 1 und b an Locus 2 auf Chromosom 1. Er hat auch a an Locus 1 und B an Locus 2 auf Chromosom 2. Machen Sie A und B aus den verschiedenen Chromosomen interagieren? Meine Intuition ist ja, aber ich möchte eine Bestätigung.

Danke vielmals!!!

Antworten (1)

Frage 1: Die von Ihnen beschriebenen Phänomene, bei denen es darauf ankommt, ob Sie eine oder zwei Kopien eines Allels haben (z. B. dass der AA-Phänotyp anders ist als der Aa-Phänotyp), werden als Dominanzeffekte bezeichnet . Dominanzeffekte können mit epistatischen Effekten interagieren (bei denen der phänotypische Effekt eines Locus vom Genotyp des anderen Locus abhängt).

Ein gutes Beispiel ist die Wechselwirkung zwischen dem Agouti - Locus und dem Mc1R- Locus in der Oldfield-Maus ( Peromyscus polionotus ) bei der Bestimmung der Fellfarbe. Homozygote mit dunkler Farbe für den Agouti - Locus haben unabhängig vom Allel am Mc1R - Locus dunkle Mäntel, während die Farbe bei Agouti -Heterozygoten oder hellen Homozygoten vom Genotyp am Mc1R- Locus abhängt. Die folgende Abbildung von Steiner et al (2007) veranschaulicht:

Dominanz und epistasische Effekte in der Fellfärbung

Frage 2 : Epistatisch interagierende Loci müssen nicht auf demselben Chromosom sein. Die oben diskutierten Loci liefern ein vollkommen gutes Beispiel. Mc1R befindet sich auf Chromosom 1, während Agouti auf Chromosom 7 liegt, doch interagieren sie epistatisch.

Ah! Ich kann nicht glauben, dass ich völlig vergessen habe, dass es verschiedene Arten von Dominanz gibt. Speziell in Frage 1 wäre dies entweder Kodominanz oder Zwischendominanz, ist das richtig?
Ich bin mir nicht sicher, ob ich verstehe, was Sie fragen. Wenn wir die Allele A und a haben, können wir Dominanz (Aa und AA haben denselben Phänotyp), Kodominanz (Aa hat sowohl den aa- als auch den AA-Phänotyp) oder unvollständige Dominanz (Aa hat einen Phänotyp zwischen aa und AA) haben.
Epistase über Chromosomen hinweg und Individuen „homozygot für Interaktionen“
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