Erläuterung der Begriffe „Downstream-Signalisierung“ und „Upstream-Signalisierung“

Was bedeuten in der Molekularbiologie die Begriffe „Downstream-Signaling“ und „Upstream-Signaling“? Was ist der Unterschied zwischen ihnen?

Sie denken an Transkriptionsfaktoren? Oder ist es mehr Signaltransduktion?
@Chris Nun, ich bin mir nicht sicher. Ich nehme an, dass man in beiden Kontexten die gleichen Begriffe verwendet, weil sie etwas gemeinsam haben, oder? Ich suche nach einer Erklärung dieser Begriffe in ihrer häufigeren Verwendung.

Antworten (2)

Es bedeutet einfach nach und vor in Bezug auf den Informationsfluss auf einem bestimmten Weg. Betrachten Sie zum Beispiel diese schematische Darstellung eines Pfads:

TF1 ==activates==> gene1 ==produces==> Kinase1 ==phosphorylates==> ProtA 

In diesem Schema befindet sich Kinase1 stromabwärts von TF1 und stromaufwärts von ProtA. Oder, um ein klassisches Beispiel zu nehmen ( Quelle ):

                                              Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

MEK1/2 ist hinter Raf und vor ERK1/2.

Vielleicht lohnt es sich, darauf hinzuweisen, dass es einen Informationsfluss in einem Signalweg gibt, sodass Sie an jedem Punkt in diesem Fluss nach oben schauen können, woher die Informationen kommen, oder nach unten, wo sie hingehen. Daher kommt die Metapher.

Wenn Sie an einen Transkriptionsfaktor denken, dann muss dieser Faktor reguliert werden. Dies geschieht entweder über Signalwege und auch auf der Ebene der Genexpression (wie viel des Faktors verfügbar ist). Alles, was diesen Faktor regelt, wird Upstream genannt (siehe Bild unten).

Alles, was durch unseren Faktor (andere Gene) reguliert wird, ist ihm nachgeschaltet. Ich denke, diese Begriffe stammen aus den Flussdiagrammen, die in diesem Zusammenhang ziemlich üblich sind.

Schauen Sie sich die Abbildung an (von SABiosciences )

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Hier kommt das Signal von der Membran und wird durch verschiedene Faktoren vermittelt, bis es in den Zellkern gelangt.