Ich lese das Handbuch der Neurochemie und molekularen Neurobiologie und lerne etwas über das Zelladhäsionsmolekül NCAM2 und bin auf Folgendes gestoßen:
Die Gesamtstruktur von NCAM2 ähnelt der von NCAM. Somit besteht NCAM2 aus fünf Ig‐Modulen (angeblich vom C2‐Typ), gefolgt von zwei Fn3‐Modulen. Das Protein existiert in einer GPI-verankerten Isoform und in einer Transmembran-Isoform, die ein 20–25 Aminosäuren langes Transmembransegment gefolgt von einem 106–119 Aminosäuren langen zytoplasmatischen Schwanz enthält (Alenius und Bohm, 1997; Yoshihara et al., 1997).
Ich weiß, dass NCAM2 an der Zellmembran lokalisiert ist und eine extrazelluläre, transmembrane und intrazelluläre Domäne hat. Für die obige Aussage jedoch: Das Protein existiert in einer GPI-verankerten Isoform und in einer Transmembran-Isoform, die ein 20–25 Aminosäuren langes Transmembransegment gefolgt von einem 106–119 Aminosäuren langen zytoplasmatischen Schwanz enthält, ist der Begriff „Transmembransegment“ Äquivalent zur Transmembrandomäne? Ist ferner der Begriff „zytoplasmatischer Schwanz“ gleichbedeutend mit der intrazellulären Domäne? Jeder Einblick wird geschätzt.
Ich gebe mich geschlagen, wenn ich versuche, den Abschnitt in dem von Ihnen verlinkten Text zu finden - wenn Google etwas nicht kann, dann ist es die Suche . Aber Fragen wie diese stellt man besser an Uniprot , das ziemlich viele Informationen liefert. Wenn Sie diesem Link folgen, werden Sie sehen, dass sie 21 AA der Transmembrantopologie von 698 bis 718 identifizieren , mit einer zytoplasmatischen Domäne danach. Der zytoplasmatische Schwanz ist also die intrazelluläre Domäne.
Es gibt gewissermaßen eine zweite Transmembrandomäne – das Signalpeptid von 1-19 – aber weil es gespalten wird, wird ihm wenig Aufmerksamkeit geschenkt. Die extrazelluläre Domäne beginnt bei 20 mit einem N-Terminus außerhalb der Zelle.
Um Wikipedia zu zitieren, bezeichnet eine Transmembrandomäne "normalerweise eine einzelne Alpha-Helix eines Proteins". Sie sollten ihnen bei einem solchen Thema wahrscheinlich zuhören, weil niemand mehr auf Semantik fixiert ist (es ist eine Art Abstimmung). Philosophisch können Sie sich vorstellen, dass mehrere Transmembransegmente als funktionelle Einheit fungieren könnten – aber jedes dieser Segmente wäre durch eine Region extrazellulärer oder intrazellulärer Sequenz vom nächsten getrennt. Eine "Domäne" in einem Protein ist eine in sich geschlossene Einheit in der Primärsequenz , nicht nur eine Reihe von Helices, die sich als nahe beieinander herausstellen, so dass das nicht funktionieren würde. Und tatsächlich, wenn Sie sich ein GPCR-Papier ansehen , sprechen sie in Standardbegriffen von sieben Transmembrandomänen, selbst wenn sie analysieren, wie sie zusammen funktionieren.