Meine Frage hängt eng mit diesem Beitrag zusammen .
Es gibt eine Reihe bestehender Plattformen zur Durchführung numerischer individuenbasierter Simulationen in der Populationsgenetik. Eine fast vollständige Liste solcher Plattformen finden Sie hier .
Einige Programme (wie zum Beispiel NEMO oder SFS_CODE) führen Vorwärtssimulationen durch, während andere (wie zum Beispiel SIMCOAL2) Rückwärtssimulationen (Koaleszenz) durchführen.
Ich bitte um einen allgemeinen Vergleich zwischen diesen beiden Methoden.
Ihre Intuitionen scheinen alle richtig zu sein. Die Koaleszenzsimulation sollte schneller sein, da Sie nicht die gesamte Populationsgeschichte über alle t-Generationen verfolgen, wie dies bei der Vorwärtssimulation der Fall ist. Wenn Sie in der Zeit rückwärts arbeiten, verfolgen Sie vielmehr eine immer kleinere Population. Und bei Koaleszenzsimulationen ist es wahrscheinlich sehr schwierig, die gesamte Bandbreite evolutionärer Prozesse einzubeziehen, während dies bei Vorwärtssimulationen mehr oder weniger trivial ist.
Ein Artikel von Carvajal-Rodriguez aus dem Jahr 2008 geht detaillierter auf einige der Probleme ein, die ich hier habe.