Hintergrund
Viele Modelle, einschließlich der berühmten allerersten Modelle, die von Sir Ronald Fisher in seiner frühen Karriere abgeleitet wurden, gehen von einer unendlichen Populationsgröße aus. In einer unendlichen Population kann die Häufigkeit eines Allels zunehmen (wenn seine Fitness größer ist als die Fitness seines Gegenstücks/ seiner Gegenstücke). Dieser Anstieg folgt einer logistischen Kurve, die nie genau eine Häufigkeit von 1 erreicht. Daher trifft der Begriff Fixierung auf diese Modelle nicht zu und folglich wurde das Konzept der Quasifixierung geschaffen.
Frage
Ein Allel gilt als quasifix, wenn es eine Häufigkeit erreicht, die sehr nahe bei 1 liegt. Aber wie nahe? Die Entscheidung ist offensichtlich willkürlich, aber wenn ein kontinuierliches Approximationsmodell in einer endlichen Population verwendet wird, stellt sich zwangsläufig die Frage und es muss eine Entscheidung getroffen werden. Wie nahe sollte die Häufigkeit eines Allels bei 1 liegen, damit es als quasi fixiert gilt? Die Antwort ist wahrscheinlich eine Funktion der Populationsgröße . Welche Schwelle verwenden Autoren normalerweise in der Literatur zur theoretischen Populationsgenetik? Es wäre auch schön, die Definition des Autors zu haben, der diesen Begriff zuerst geprägt hat.
Garrish und Lensky (1998) betrachteten das Erreichen der Fixierung wann , wo ist die Allelfrequenz und die Bevölkerungsgröße.
Beachten Sie, dass ich Simulationen (unveröffentlicht) durchgeführt habe, die den von Garrish und Lensky (1998) gewählten Schwellenwert gut annäherten .
Da ich keine Richtlinie gefunden habe, habe ich mich einfach für eine Schwelle entschieden für eine diploide Population. Allel gilt daher als quasifest, wenn seine Frequenz ist größer als dh die Anzahl der Vorkommen (count) oder das andere Allel ist geringer als .
rg255
FloriOn