F-Statistiken in der Populationsgenetik verstehen

Ich lese gerade die klassische Abhandlung von Weir und Cockerham aus dem Jahr 1984 darüber F S T Einschätzung. Zu Beginn (erste Seite, rechte Spalte) definieren sie 3 Statistiken.

  • F ist die Korrelation von Genen innerhalb von Individuen ("Inzucht")

  • θ ist die Korrelation von Genen verschiedener Individuen in derselben Population ("Coancestry")

  • f ist die Korrelation von Genen innerhalb von Individuen innerhalb von Populationen.

Sie geben auch an, dass die 3 Statistiken zusammenhängen

f = ( F θ ) ( 1 θ )

Ich verstehe diese 3 Statistiken nicht ganz und vor allem verstehe ich nicht, warum diese Beziehung zutrifft. Kannst du mir damit helfen?

Ich finde das Papier von 1984 an manchen Stellen etwas dicht. Ich habe im Moment keine Zeit, das zu erläutern, aber ich fand das Buch von Bruce Weir sehr aufschlussreich. Sie müssen es nicht direkt durchlesen. Es gibt zwei oder drei relevante Kapitel. Für Ihre Frage könnte jedoch ein gutes Populationsgenetik-Lehrbuch wie Hartl und Clark ausreichen.

Antworten (1)

Ich bin bei diesem Thema etwas wackelig, aber ich denke, die wichtigste Information ist, dass sie Wrights (1951) hierarchische Analyse der Variation, "F-Statistik", "hierarchische Partitionierung der Variation" oder "Population" neu parametrisieren Parameter", je nachdem, wen Sie fragen. Die Parameter entsprechen sich wie folgt (unten auf S.1358): Fit=F, Fis=f, Fst=θ.

Die Beziehung entsteht unter bestimmten Annahmen. Entscheidend ist hier, wenn Fis (oder f) ein Maß für die Abweichung vom Hardy-Weinberg-Prinzip ist und alle Populationen identisch von HWP abweichen, dann ist Fit = 1 - Hi/Ht. Daraus folgt: 1 - Fit = Hi/Ht. Wir können dies auch umschreiben, so dass Hi/Ht = (Hi/Hs)(Hs/Ht).

Zusammen können Sie das (vielleicht) sehen, 1-Fit = (1−Fis)(1−Fst). Einsetzen, 1-F = (1-f)(1-θ).

(Mir ist klar, dass dies keine vollständige Antwort ist, aber Sie können sie mit etwas Algebra neu anordnen, um die Weir & Cockerham-Gleichung zu erhalten, denke ich).

[Update 25. Oktober 2016]: Es ergibt schließlich f = (F-θ)/(1-θ). Ich denke, die gepostete Frage (oben) enthält einen Tippfehler - insbesondere einen fehlenden Divisionsoperator. Vielleicht hat jemand den Strich auf einer Schreibmaschine in der Originalarbeit übersehen?

Danke für die Antwort. Lösen 1 F ( 1 f ) ( 1 θ ) zum f gibt f = θ F θ 1 .