Tandemwiederholungssequenz; Ursachen der Kontraktions- und/oder Expansionsfrage
Chris Koch
Frage:
Welche der folgenden Ereignisse, die innerhalb einer Tandem-Wiederholungssequenz auftreten, verursachen eine Ausdehnung oder Kontraktion des Arrays?
A) Endoduplikation B) homologe Rekombination C) Ungleiches Crossing-over D) Fehleranfällige DNA-Reparatur E) Inversion
Ich weiß mit Sicherheit, dass Tandem-Wiederholungen von DNA (insbesondere Trinukleotid-Wiederholungen) bei der Replikation Schleifen bilden können, die durch Mismatch-Reparaturenzyme (MSH2-MSH3) repariert werden; und wenn dies nicht korrigiert wird, würde dies zu einer Erweiterung des Arrays nach der Replikation führen. Diese Antwort war jedoch falsch.
Könnte mir jemand bei dieser Frage weiterhelfen? Ich habe mich in das Thema eingelesen, aber es ist mir nicht klar, warum DNA-Reparaturdefekte nicht als Antwort ausreichen. Ich verstehe auch nicht unbedingt die richtige Antwort (C)
Vielen Dank
-Chris
Antworten (1)
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Die Genduplikation würde nicht zu einer Kontraktion führen (nur zu einer Expansion). Die Endoduplikation würde alle Gene im Chromosom betreffen. Eine fehleranfällige Reparatur würde kleine Indels verursachen, aber keine Erweiterung der Wiederholungen. Inversion wird sicherlich nichts mit der Sequenz tun, außer ihre Orientierung zu ändern.
Während eines ungleichen Crossovers können sich die Chromosomen aufgrund mehrerer Ausrichtungsstellen in der Wiederholungsregion unvollkommen ausrichten, was zu ungleichen Crossover-Produkten führt. Die Überkreuzung erfolgt jedoch im Wesentlichen aufgrund homologer Rekombination. Crossover ist ein „Phänomen“ und kein „Mechanismus“ im eigentlichen Sinne.
Crossover-Mechanismus
Reproduziert aus : Bugreev, Dmitry V., et al. „ Die Resistenz von DMC1-D-Loops gegen die Dissoziation kann für den DMC1-Bedarf bei der Meiose verantwortlich sein. “ Nature Structural & Molecular Biology 18.1 (2011): 56-60.
Eine andere zu beachtende Sache ist, dass homologe Rekombination ohne Crossover zu einer Expansion von Repeats, aber nicht zu einer Kontraktion führen kann (siehe unten).
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