Warum ist PEG wichtig für eine effiziente Hefetransformation?

Eine Möglichkeit, eine Hefetransformation durchzuführen, besteht in der Verwendung von Lithiumacetat, einer einzelsträngigen Träger-DNA und PEG (1) . Ich habe mich gefragt, warum das Polyethylenglykol für die effiziente Umwandlung wichtig ist. Wie wirkt es sich auf die Aufnahme der Fremd-DNA aus? Yamakawa et al. (2) zeigten, dass PEG für die Wiederherstellung der Zellen unerlässlich ist, aber ich konnte nicht auf dieses Papier zugreifen, um mehr darüber zu lesen.

1. R. Daniel Gietz & Robert H. Schiest (2007). Hocheffiziente Hefetransformation mit der LiAc/SS-Träger-DNA/PEG-Methode

2. Yamakawa, M., Hishinuma, F. und Gunge, N. (1985). Transformation intakter Zellen von Saccharomyces cerevisiae durch Polyethylenglycol. Agrar. biol. Chem. 43, 869-871.

PEG bewirkt Fusion von Protoplasten (allgemein Lipid-Doppelschichten)
Ich habe diesen Artikel gefunden, der Ihre Frage beantworten könnte: Shigeyuki Kawai1, Tuan Anh Phan1, Emi Kono1, Kazuo Harada2, Chihiro Okai2, Eiichiro Fukusaki2 und Kousaku Murata1 (2009). Transkriptionelle und metabolische Reaktion in Hefezellen von Saccharomyces cerevisiae während der Polyethylenglykol-abhängigen Transformation. Journal of Basic Microbiology 2009, 49, 73 – 81 Ich denke, das ist der richtige Link: onlinelibrary.wiley.com/store/10.1002/jobm.200800123/asset/…
Es ist eher ein Kommentar, aber ich kann aufgrund meiner Wiederholungspunkte keinen hinzufügen. Zusätzlich zu dem, was andere bereits hinzugefügt haben, wurde mir auch gesagt, dass PEG bei der Stabilisierung der Hefezellen hilft und dadurch ihre Erholung erhöht. Ich kann das Nature Protocol Paper von Gietz et al. nicht teilen, aber dies ist ein Buchkapitel von denselben Autoren zum selben Thema: researchgate.net/profile/R_Gietz/publication/…

Antworten (2)

http://www.protocol-online.org/biology-forums/posts/26634.html

Ich habe diesen Link gefunden - er sagt "wir wissen es nicht wirklich". Es heißt, PEG bindet DNA, ich nehme an, dass es die Membran vor ihrer negativen Ladung schützt und die Internalisierung ermöglicht.

Ich würde vermuten, dass die amphipathische Natur von PEG, da es teilweise hydrophob ist, auch dazu beiträgt, die Membran weicher zu machen. Interessanterweise verringert sich die Effizienz des Verfahrens, wenn Sie die PEG-Konzentration über die Grenzen hinaus erhöhen.

Ich nehme an, es hat eine analoge Funktion in Ligationspuffern. Dort nimmt es offenbar einen großen Teil des Volumens ein und erhöht dadurch die Wahrscheinlichkeit einer Wechselwirkung zwischen DNA-Stücken.

In einem Transformationspuffer sollte es die Wahrscheinlichkeit erhöhen, dass DNA in eine Zelle gelangt. Leider war die einzige Referenz, die ich dazu gefunden habe, bei Bitesizebio: http://bitesizebio.com/20/5-dna-ligation-tips/