Ich lese Pan et al. (2000) , eine Veröffentlichung über Dihydrofolatreduktase (DHFR). Sie behaupten, ein Ensemble-basiertes Modell von DHFR zu verwenden.
Was ist ein Ensemble-basiertes Modell ?
Ein „Ensemble“ ist eine Menge verwandter Modelle einer Struktur.
Beispielsweise beschreiben Konformationsensembles die Struktur flexibler Proteine. Eine Datenbank solcher Strukturen gibt es hier: http://pedb.vib.be/ .
Wenn NMR zur Bestimmung einer Struktur verwendet wird, ist das Ergebnis ein Ensemble von Strukturen (siehe diesen Artikel für einen Vergleich mit der Kristallographie). Es ist jedoch auch möglich, mehrere Strukturen für die Kristallographie zu sehen. Diese Abhandlung über „Zugriff auf Protein-Konformations-Ensembles mit Raumtemperatur-Röntgenkristallographie“ beschreibt die Einschränkungen der Idee von Kristallstrukturen mit einer einzigen Struktur.
Remi.b
Mohammed Nureldin