Was bedeutet "lokale Faltung" in der Sekundärstruktur?

Ich bin neu auf dem Gebiet der Biologie, also lerne ich alle möglichen biochemischen Kenntnisse für ein Bioinformatik-Projekt. Ich habe online ein paar Definitionen der Sekundärstruktur gefunden. Ich habe zum Beispiel diese kurze Definition hier gefunden:

Eine Struktur eines biologischen Moleküls, die durch die lokale Faltung innerhalb des Biopolymers als Ergebnis einer Wasserstoffbindung (innerhalb des Biopolymers) gekennzeichnet ist.

Was bedeutet hier „lokales Falten“? Genauer gesagt, worauf bezieht sich "lokal" in diesem Zusammenhang? Danke im Voraus.

Bitte geben Sie einen Link zu Ihrem Angebot an. Wir müssen in der Lage sein, es im Zusammenhang zu sehen.

Antworten (1)

Die häufigsten Beispiele für Sekundärstrukturen in Proteinen sind Alpha-Helices und Beta-Faltblätter, und der wichtigste Unterschied zwischen Sekundär- und Tertiärstruktur besteht darin, dass ein einzelnes Protein innerhalb seiner vollständigen globalen Struktur mehrere "lokale Strukturen", Alpha-Helices und Beta-Faltblätter, aufweisen kann . Im Gegensatz dazu kann ein Protein per Definition nicht mehrere "globale Strukturen" haben.

Mit anderen Worten, eine lokale Struktur kann innerhalb eines Proteins mehrfach vorkommen, während eine globale Struktur per Definition nur einmal vorkommen kann und die vollständige Form des Proteins beschreibt.

Ok, es bedeutet also ein lokales Segment der globalen Struktur? Und da die Sekundärstruktur nicht die genaue Position eines Atoms angibt, ist sie nur eine allgemeine Vorlage, um darzustellen, was es ist? Und daher spezifiziert die Sekundärstruktur nicht die Funktion dieses Segments?
Sekundärstrukturen haben keine festgelegten Positionen in einem Protein, sie können je nach Protein fast überall vorkommen. Sekundärstrukturen haben jedoch oft wichtige Funktionen. Beispielsweise sind Alpha-Helices nützlich für Proteine, die an DNA binden, und für Proteine, die Zellmembranen durchqueren.
Es ist interessant zu wissen, dass die Sekundärstruktur eine solche generische Funktion hat. Können Sie auch kurz erklären, warum die Sekundärstrukturen fast überall vorkommen können?
Es gibt wahrscheinlich einige strukturelle Einschränkungen dafür, wo Sekundärstrukturen auftreten können, um ein energetisch stabiles Falten und Biegen zu ermöglichen, aber ich bin mit ihnen nicht allzu vertraut. Sekundärstrukturen sind jedoch sehr verbreitet - warum? wahrscheinlich keine bessere Antwort, als dass die Evolution sie einfach nützlich fand. Es ist ziemlich einfach, Sekundärstrukturen zu konstruieren, Sie müssen nur sicherstellen, dass Ihre lineare Sequenz von Aminosäuren bestimmte biochemische Eigenschaften hat, wie viele MALEK: en.wikipedia.org/wiki/Alpha_helix#Amino-acid_propensities
Dies ist sehr hilfreich für mich, um zu verstehen, was vor sich geht, da ich einige Artikel gelesen habe, die diese Parameter verwenden, um die Sekundärstruktur vorherzusagen.
Kein Problem! Froh, dass ich Helfen kann.