Wie berechnet man Ki-Werte?

Es ist mir peinlich, das zu fragen, aber nun ja, so ist das Leben. Die Ki-Datenbank des NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP) wird als Quelle der durchschnittlichen Werte der Bindungsaffinität (K i ) erwähnt, die in Goodman und Gilman angegeben sind, aber wann immer ich versuche, in irgendeiner Weise zu bestätigen, dass diese Werte Durchschnittswerte sind, die von PDSP I erhalten wurden erhalten Sie Werte, die weit (bis zum 10.000-fachen) von den in Goodman und Gilman angegebenen Werten abweichen. (ps. Ich bin auch Mathematiker, also weiß ich, wie man einen Durchschnitt bildet, X ¯ = ∑ ich N X ich N Sie müssen mir also nicht mit etwas so Einfachem wie der herkömmlichen Definition von Durchschnittswerten die Hand durch die Berechnung halten.) Daher bin ich zu dem Schluss gekommen, dass ich die Berechnungen falsch machen muss. Bitte zeigen Sie mir, wie man sie richtig macht. Hier ist ein Screenshot von genau dem, was Goodman und Gilman sagen, was mich verwirrt:

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Oh und ja, ich verwende nur die Werte der geklonten menschlichen Transporter, nicht nur all das Zeug, das auftaucht.

Überprüfen Sie die Einheiten. Möglicherweise liegt ein Konvertierungsproblem von μM in nM vor. Überprüfen Sie dies
Nein, alle Einheiten sind nM.
Es wäre besser, wenn Sie diese Seite als Dokument oder PDF speichern und in Dropbox ablegen könnten. Wenn es ein E-Book gibt, geben Sie bitte die URL an, wenn dies möglich ist.
Letzteres wäre ein Urheberrechtsverstoß und bei dem anderen verstehe ich nicht ganz, wie das besser sein soll.
Teilen der URL: wenn sie geöffnet ist, wie z. B. in den Büchern auf der NCBI-Website. Besser: damit ich nicht hineinzoomen muss, um zu sehen.

Antworten (1)

Seit ich diese Frage gestellt habe, habe ich herausgefunden, was ich bei der Suche nach K i -Werten falsch gemacht habe (dh ich dachte, die K i -ID sei der Testligand und suchte daher falsch nach Medikamenten), aber auch wie, denke ich, Goodman und Gilman erhielt seine K i -Werte.

Ich denke, was sie getan haben, war, dass sie nach dem heißen Liganden gesucht haben, der die konsistentesten und zahlreichsten K i -Werte ergab, und den Durchschnitt der konsistenten K i -Werte genommen haben (mit einer relativen Toleranz von ~ 100% zwischen den Ergebnissen). Da ich außerdem wusste, dass die Daten, wie auf der oben angezeigten Seite angegeben, am 30. Juni 2009 aufgenommen wurden, konnte ich einige Quellen eliminieren, die zu diesem Zeitpunkt wahrscheinlich nicht auf PDSP verfügbar waren. Dadurch konnte ich in den allermeisten Fällen konsistente gemittelte K i -Werte erhalten (mit höchstens einer kleinen Handvoll Ausnahmen).

Wie berechnet man Ki-Werte?
AntwortenHierDatenschutz-Bestimmungen1y, 0v