Abfrage von einer ppt-Folie

Ich bin auf diese Folie gestoßen: Jetzt habe ich nicht verstanden, was die letzten beiden grauen Linien bedeuten. Kann ORFS nicht beliebig groß sein? Was sind hier überlappende Frames?
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Antworten (1)

Kann ORFS nicht beliebig groß sein?

Ich denke, der Punkt ist, dass in einer zufälligen Sequenz von 64 Aminosäuren im Durchschnitt 3 von 64 Stoppcodons sein sollten, weil es drei mögliche Nukleotidsequenzen für Stoppcodons gibt (UAA, UAG, UGA). ORFs könnten theoretisch jede Größe haben, aber je länger die Sequenz ist, desto wahrscheinlicher ist es, dass Sie rein aufgrund der Wahrscheinlichkeit auf ein Stoppcodon stoßen.

Was sind hier überlappende Frames?

Ein Beispiel für überlappende Frames wird auf der Folie gezeigt:Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Zum Beispiel können Sie sehen, dass das erste „CU“ im ersten Rahmen ein Alanin (als G CU ) produziert, während das „CU“ im zweiten Rahmen ein Leucin (als CU U) produziert.

Sie haben die gleiche Nukleotidsequenz, sind aber versetzt, um unterschiedliche Aminosäuren zu produzieren. Viren haben sehr "verdichtete" Genome und können oft dieselbe Nukleotidsequenz für verschiedene Gene verwenden, indem sie einfach an verschiedenen Punkten in dieser Nukleotidsequenz beginnen. Das bedeutet, dass sie funktional überlappende Rahmen haben.

"Aber je länger die Sequenz, desto wahrscheinlicher ist es, dass Sie rein aufgrund der Wahrscheinlichkeit auf ein Stoppcodon stoßen." was bedeutet diese zeile
also haben sie die Rahmengröße hier mit 3 betrachtet
@Rishika Ein Leserahmen ist immer 3 Nukleotide. Alles, was ich sage, ist, dass Sie in einer zufälligen Sequenz von Nukleotiden, wenn Sie zufällig drei auswählen, 3 von 64 Malen auf ein Stoppcodon stoßen sollten. Stellen Sie sich das so vor, als würden Sie eine Straße hinunterfahren, auf der alle paar Blocks Ampeln stehen. Vielleicht haben Sie Glück und haben 5 Ampeln hintereinander grünes Licht, aber es ist statistisch unwahrscheinlich, dass Sie ein rotes Licht über eine sehr lange Distanz vermeiden können. Stellen Sie sich das Stoppcodon wie ein rotes Licht vor.
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