Aktuelle und qualitativ hochwertige Artikel zur Systembiologie [geschlossen]

Ich werde mich an einer kurzen Liste versuchen. Dies ist eher ein Highlight und eine Art Antwort auf eine etwas subjektive Frage. Verzeihen Sie also, wenn Sie dies nicht wollten. Ich habe keine Papierreferenzen für all dies, aber ich werde versuchen, später zurückzukommen und einige hinzuzufügen - ich habe normalerweise nur eine halbe Stunde oder so, um eine Antwort zu schreiben, also haben Sie Geduld mit mir.

Synthetische Biologie, definiert als die Verwendung von Genen und Promotoren, um Zellen oder sogar vielzellige Organismen wie Geräte zu konstruieren, ist eine Hauptkategorie. Ich stöbere gerne in den Projekten der iGem-Wettbewerbe . Einige herausragende Bemühungen auf diesem Gebiet sind die Verwendung von Photorezeptoren zur Programmierung der Genexpression von E. coli und die allgemeine Anstrengung, logische und rechnerische Schaltkreise in der Zelle zu schaffen.

Eine Hauptanwendung in der Systembiologie ist das Engineering von Zellen zur Produktion neuer chemischer Verbindungen oder zur Überproduktion von Verbindungen. Ein klassisches Beispiel (ziemlich alt, aber immer noch ziemlich herausragend) ist die Generierung von E. coli zur Produktion des Malariamedikaments Artemisinin in Mengen, die eine weltweite Freisetzung des Medikaments ermöglichen würden. Dies hat zu Bemühungen geführt, Kraftstoff auch aus Algen und Bakterien herzustellen.

Wenn Sie Systembiologie so definieren, dass sie sich oft mit der Modellierung einiger oder sogar aller biologischen Prozesse der Zelle befasst, gibt es wahrscheinlich zu viele große Anstrengungen, um sie zu zitieren, aber dies ist nur eine Liste einiger Favoriten.

Es gibt viele Artikel, die sich auf die Flussbilanzanalyse konzentrieren , die modelliert, wie die Stoffwechselmaschinerie alle Dutzende chemischer Verbindungen, aus denen eine Zelle besteht, verarbeitet und synthetisiert.

Eine andere Kategorie von Synbio versucht, die in einem Genom gefundenen Gene zu nehmen und die Aktionen aller Gene zu modellieren. Eine der aufregendsten Veröffentlichungen in dieser Art von Systembiologie ist das Ganzzellmodell von Mycobacterium genetalium . Unter Verwendung von Daten aus einem massiven Versuch, jedes Gen in diesem sehr kleinen Genom zu charakterisieren, besteht das Modell aus über 20 spezifischen Modellen, die kombiniert wurden, um eine sehr beeindruckende Simulation der gesamten Zellteilung zu erstellen.

Dann gibt es noch die Metagenomik, die sich mit den verschiedenen Populationen von Mikroorganismen befasst und versucht zu untersuchen, wie sie sich bei unterschiedlichen Umweltbedingungen verändern. Eine aufregende aktuelle Veröffentlichung ist die Überprüfung, wie verschiedene Bakterien im Darm von fettleibigen Mäusen und Menschen dominieren (mehrere Referenzen im Link). Eine Tour de Force in der Metagenomik war die globale Meeresvermessung .

Diese Frage ist äußerst vage und kann keine wirkliche Antwort geben, ohne dass Sie eine Frage angeben oder sich zumindest konzentrieren. Denken Sie daran, dass es für die Forschung keine Autobahn gibt, Sie müssen sich einarbeiten und anfangen, Artikel zu lesen, um Ihr Fachgebiet zu verstehen. Wenn Sie Hilfe von anderen benötigen, sollten Sie sich zumindest die Zeit nehmen, die Artikel aufzulisten, die Sie bereits gelesen haben, und warum sie Ihnen gefallen haben, um den Lesern einen Vorgeschmack auf Ihre Interessen zu geben.

Betrachten Sie zu Beginn diese Google Scholar-Suchanfrage für Systembiologie seit 2009 . Wenn Sie bestimmte ältere Artikel gelesen haben, die Ihnen gefallen haben, zum Beispiel diese beliebte Minu-Umfrage von 2002:

Kitano, H. (2002). Systembiologie: ein kurzer Überblick. Wissenschaft , 295(5560), 1662-1664.

Dann können Sie erfahren, wie sich das Gebiet seitdem entwickelt hat, indem Sie eine Vorwärtssuche in Scholar durchführen (und auf 2009+ beschränkt ). Hoffentlich liefert Ihnen dies einige Ideen, damit Sie eine genauere Frage stellen können!