Faktoren, von denen die Umwandlung einer Verbindung in eine andere Verbindung abhängt [geschlossen]

Unter Berücksichtigung des Stoffwechselwegs:
http://www.genome.jp/kegg-bin/show_module?M00166

Betrachten Sie die Reaktion R01523 (die allererste Reaktion). Wie kann man wissen, dass die Verbindung C00199 (D-Ribulose-5-Phosphat) in C01182 (D-Ribulose-1,5-Bisphosphat) umgewandelt wird?

Von welchen Faktoren hängt diese Transformation ab? Ein Faktor, den ich kenne, ist die Struktur, aber wie wirkt sich die Struktur auf diese Transformation aus? Bedeutet zwei ähnlich strukturierte Verbindungen, dass eine der Verbindungen in die andere umgewandelt werden kann?

Antworten (1)

Aus meiner Antwort auf Chemie :

Nachdem ich mir die Website angesehen hatte, stellte ich fest, dass die Reaktion auf einem Enzym namens Phosphoribulokinase basiert. In biologischen Systemen laufen viele Reaktionen unter der Schirmherrschaft von Enzymen oder Proteinen ab. Dies sind unglaublich große Moleküle, die aus einer extrem langen Kette von Aminosäuren bestehen, die ein Satz von etwa 26 kleinen Molekülen sind, die sich in die Kettenstruktur eines Proteins „einhaken“ können. Jede Aminosäure hat unterschiedliche Eigenschaften und erfährt daher unterschiedliche Kräfte, die sie zu anderen Aminosäuren in der Kette hin und von ihnen wegziehen. Das bedeutet, dass sich die gesamte Kette zu einer äußerst komplexen Struktur zusammenfaltet. Damit ein Protein eine Reaktion zulassen kann, hat es eine kleine Region, in die sich das reagierende Molekül einhaken kann. Es gibt dann Sätze von Atomen und Molekülen, die als Gerüste fungieren, die es ermöglichen, Atome im reagierenden Molekül zu bewegen, ohne dass fast so viel Energie benötigt wird, wie ohne das Gerüst erforderlich wäre. So verändert es nun die Struktur. Nun, während das Protein ebenso leicht die Rückverwandlung des produzierten Moleküls in das ursprüngliche Molekül ermöglichen kann, kann dies energetisch weniger günstig sein, was uns zu einer Gleichgewichtschemie mit dynamischen Vorwärts- und Rückwärtsreaktionen bringt. Was dies noch komplizierter macht, ist, dass Proteine ​​oft separate "Haken" für Moleküle haben, um sie zu deaktivieren. Das heißt, wenn viel Substanz A vorhanden ist, wird das Protein deaktiviert und wandelt B nicht mehr in A um, bis mehr A verbraucht wird und somit die Hemmung des Proteins aufhört. für Moleküle, um sie zu deaktivieren. Das heißt, wenn viel Substanz A vorhanden ist, wird das Protein deaktiviert und wandelt B nicht mehr in A um, bis mehr A verbraucht wird und somit die Hemmung des Proteins aufhört. für Moleküle, um sie zu deaktivieren. Das heißt, wenn viel Substanz A vorhanden ist, wird das Protein deaktiviert und wandelt B nicht mehr in A um, bis mehr A verbraucht wird und somit die Hemmung des Proteins aufhört.