Ich habe ein Buch, in dem steht:
Beim Menschen ist Titin eine Kette von 34.350 Aminosäuren, bei Mäusen ist sie mit 35.213 Aminosäuren sogar noch länger.
Wenn zwei Polypeptide unterschiedliche Aminosäuresequenzlängen haben, wie können sie dann als dasselbe Protein betrachtet werden? Oder werden beide als dasselbe Protein betrachtet, weil sie eine oder mehrere Aminosäuresequenzen gemeinsam haben – die Biologen, wenn sie ein Polypeptid enthalten, als eine bestimmte Art von Protein betrachten?
Wenn sie genau die gleiche Funktion erfüllen, können sie als funktionell gleich angesehen werden .
Hämoglobin ist bei den meisten Menschen bis auf die Aminosäuresequenz gleich; das Hämoglobin bei Sichelzellenanämie, Hämoglobin C, Hämoglobin SC, Thalassämie und andere unterscheiden sich alle in mindestens einer Aminosäure, dennoch sind sie alle Hämoglobine und erfüllen alle die gleiche Aufgabe: Sie transportieren und setzen Sauerstoff frei. Insulin bei Menschen und Schweinen ist nicht identisch (Humaninsulin unterscheidet sich von Schweineinsulin durch eine einzige Aminosäure – Thr statt Ala – am C-terminalen Rest der B-Kette – aber sie sind beide Insulin, haben jeweils eine identische Funktion Tier.
Offensichtlich sind zwei Proteine unterschiedlicher Länge nicht identisch. (Hat das Buch behauptet, dass sie identisch seien? Wenn ja, war es ein Fehler.) Wenn sie genau die gleiche Funktion erfüllen, können sie beide den gleichen Namen tragen und als funktionell dasselbe Protein betrachtet werden.
Human - und Maus - Titin sind Orthologe und können durch eine NCBI - Abfrage für TTN bestätigt werden .
Orthologe Proteine sind per se nicht gleich . Sie behalten die gleiche Funktion bei und resultieren im Wesentlichen aus Artbildung: Das gemeinsame Ahnengen wurde zwischen zwei Arten aufgeteilt. Die Reihenfolge kann sich jedoch möglicherweise unterscheiden, da sich die Arten offensichtlich voneinander getrennt haben.
Die Homologie zwischen den beiden kann rechnerisch durch phylogenetische und Ausrichtungsanalysen bestätigt werden, aber ich glaube, dass die Namenskonvention Titin sowohl für Maus als auch für Mensch weitgehend von der Funktion des Proteins in beiden Organismen herrührt.
Namenskonventionen und Erklärungen zur Homologie sind in diesem Bio.SE-Beitrag gut umrissen .
Armatus