Ich kenne Enhancer und den Mechanismus, der sie dazu bringt, die Genexpression ihrer Ziele zu erhöhen, aber ich habe mich gefragt, ob es ähnliche DNA-Repressoren gibt. Ich kenne mich mit Protein-Repressoren aus, aber ich suche nach einer Art Anti- (oder umgekehrtem) Enhancer-Äquivalent im Genom, das wie ein Enhancer wirkt, aber die Genexpression reduziert.
Mir sind reprimierte/ausgeglichene Enhancer bekannt, die so etwas wie dieser Prozess wären, auch wenn es nicht wirklich eine reine Repression des Zielgens, sondern eher eine "Nicht-Überexpression" wäre. Ich kenne mich auch mit Isolatoren aus, aber das wäre wieder ein anderer Mechanismus.
Einige intergenische Region-Bindungsprotein-Repressoren, die durch einen Faltungsmechanismus, der Enhancern ähnlich ist, vielleicht ein Gen unterdrücken würden?
Ja, diese Sequenzen existieren und sie werden " Schalldämpfer " genannt (überraschend, oder?). Es gibt verschiedene Mechanismen, durch die dieses Stummschalten von Genen geschehen kann.
Auf „klassische“ Weise wird der Silencer von einem Transkriptionsfaktor gebunden, der entweder das Gen passiv unterdrückt, indem er die Bindung spezifischer Transkriptionsfaktoren verhindert, oder indem er aktiv den Zusammenbau der allgemeinen Transkriptionsfaktoren verhindert. Siehe die Abbildung aus Papier 1:
Zusätzlich gibt es nicht-klassische negative regulatorische Elemente (NRE), die normalerweise Elemente stromaufwärts des Promotors sind, die die bindenden regulatorischen Proteine hemmen. NRE können abhängig von den an sie gebundenen Proteinen auch Verstärker sein. Einige NRE können eine Biegung der DNA induzieren, wodurch der Zugang zu Enhancer- oder Promotorelementen gehemmt wird.
Verweise:
Nandor Poka
cagliari2005
Nandor Poka