Haben alle RNA-Polymerasen in Eukaryoten die gleichen Transkriptionsfaktoren?
stümpfe
Ich weiß, dass TFII-Proteine an cis-Elemente in der DNA binden und dabei helfen, die Transkription für die RNA-Polymerase II zu initiieren. Aber verwenden die RNA-Polymerase I und III diese Proteine auch bei der Transkription von Genen? Benötigen auch alle Gene Promotoren/cis-Elemente? Benötigen alle in einen Vektor eingebrachten Gene Promotorregionen/cis-Elemente?
Antworten (2)
adjan
Mit Ausnahme des TATA-bindenden Proteins (TBP) gibt es keine gemeinsamen Transkriptionsfaktoren für jede RNA-Polymerase. Es gibt jedoch Homologien zwischen vielen der Faktoren, die von den verschiedenen Enzymen verwendet werden.
Das Paper Conservation between the RNA Polymerase I, II, and III Transcription Initiation Machineries gibt einen guten Überblick über die verschiedenen Initiationsfaktoren der einzelnen RNA-Polymerase-Enzyme. Es enthält einen Vergleich verschiedener Transkriptionsfaktoren in Hefe.
Hier ist ein Auszug aus der Veröffentlichung, der die Homologien zwischen einigen der Initiationsfaktoren der TFII-Gruppe und ihren homologen Gegenstücken zeigt. (Das erste Schema ist RNA Poly II, das zweite RNA Poly I und das dritte RNA Poly III):
Quelle:
a Alessandro Vannini, Patrick Cramer, Conservation between the RNA Polymerase I, II, and III Transcription Initiation Machineries, Molecular Cell, Band 45, Ausgabe 4, 24. Februar 2012, Seiten 439–446, ISSN 1097–2765, https://doi .org/10.1016/j.molcel.2012.01.023 .
lona
Wahrscheinlich.
https://en.m.wikipedia.org/wiki/Conserved_sequence
Hier finden Sie eine Vielzahl konservierter Sequenzen, nicht nur in Eukaryoten, sondern in allen Organismen. Die RNA-Polymerase wurde nur in E. coli ausführlich untersucht, wo etwa 100 RNAP-verwandte Gene gefunden wurden. Alle Bakterien scheinen eine Reihe von Genen wie rpob, terminale Domänen und die Omega-Untereinheit zu teilen. In Eukaryoten gibt es außerdem die 5 Polymerase-Proteine, die der Archea-RNAP sehr ähnlich sind. Pockenviren haben ihre eigene ähnliche RNAP.
Was Retroviren betrifft, so ist die gesamte Wissenschaft hinter ihnen ziemlich vage, sodass wir nicht genau sagen können, welche RNAP-Gene sie verwenden. Es wird behauptet (ohne viele Beweise), dass sie ein paar Gene mit der Bezeichnung "pol" verwenden, um eine ähnliche Funktionalität zu erreichen.
Es wird angenommen, dass die Promotorregionen nicht unbedingt notwendig sind, obwohl sie die Transkription der meisten Gene stark beschleunigen. Sie werden in der Regel auch konserviert.
Ist „TATA-Signal“ gleichbedeutend mit „TATA-Box“?
Endet die Transkription am Ende der Antibiotikaresistenzgene auf den Duet-Expressionsplasmiden?
Wie bestimmen Zellen RNA-Typen?
Was macht/unterbricht die Wasserstoffbrückenbindungen zwischen DNA und RNA während der Transkription?
Wie wird die Transkriptionsrichtung der RNA-Polymerase bestimmt?
Wie erkennt die Zelle, ob eine RNA-Polymerase II während der Transkription ins Stocken geraten ist, und wie setzt sie wiederum die richtigen transkriptionsgekoppelten Reparaturfaktoren ein?
Ursprünge von Transkriptionsfaktoren und RNA-Polymerase
Warum und wie ist die DNA-Synthese so viel schneller als die RNA-Synthese in Bakterien?
Gibt es U-reiche Transkriptionspausen?
Codons und Exons stoppen?
Kanadier