Spickzettel zur Proteinbiologie

Ich suche einen Spickzettel für Proteinbiologie, den ich auf meinen Schreibtisch kleben kann, um mich an einige der Schlüsselprinzipien der Proteinbiologie zu erinnern. Ich erinnere mich an die spezifischen und komplexen Prinzipien der Proteinbiologie, aber auf Kosten der Grundlagen.

Kann mir jemand einen Proteinbiologie-Spickzettel zeigen oder einige Vorschläge machen, um einen zu erstellen?

BEARBEITEN

Was ich suche:

  • Menge an Aminosäuren in einer Helixwindung
  • Aminosäuren, die typischerweise in Beta-Faltblättern und Helices vorkommen
  • Die Arten von Proteinwechselwirkungen (dh ionisch, hydrophob) und die normalerweise beteiligten Aminosäuren.
  • Definition von Kugel- und Faserform
  • Arten posttranslationaler Modifikationen
  • Alle anderen nützlichen Eigenschaften
Willkommen bei Biology.SE. Diese Frage ist vielleicht zu vage, um sie hier vernünftig zu beantworten. Ich würde vorschlagen, mit der Lektüre eines Lehrbuchs für Molekular- oder Zellbiologie auf Einstiegsniveau zu beginnen. Vielleicht könnten Sie genauer eingrenzen, für welche Teilmenge der Proteinchemie Sie nach einem Spickzettel suchen. Beispielsweise Aminosäureeigenschaften, Klassen von Proteinstrukturen und -funktionen, posttranslationale Modifikation.
Verwandte: Ein Freund von mir hat dieses Periodensystem der Aminosäuren erstellt . Das Original ist auf Italienisch, aber eine englische Übersetzung ist am Ende dieses Forumsbeitrags angehängt. Außerdem sind SVG-Quellen verfügbar und es steht unter einer BY-NC-SA CC-Lizenz, sodass Sie es nach Ihren Wünschen ändern/erweitern können.

Antworten (3)

Für 95 % der Arbeit, die ich mit Proteinen mache, finde ich diese Tabelle sehr hilfreich, die häufige posttranslationale Modifikationen für jede Aminosäure zeigt, mit Molekulargewichten, zugehörigen Codons, pKa-Werten, 1- und 3-Buchstaben-Aminosäurecodes, chemische Struktur und chemische Eigenschaften (polar, unpolar, aromatisch, sauer, basisch).

Ich denke, dies ist eine Frage darüber, was sonst noch auf einem Protein-Spickzettel stehen sollte.

Wenn Sie schlau sind, können Sie dies so formatieren, dass es eine sehr hohe Informationsdichte hat. Ein gutes Projekt.

Hier ist meine Liste - ich habe aber nie ein Blatt gemacht. Außerdem interessiere ich mich eher für die Proteinstruktur, also gibt es hier eine Tendenz.

  • Die Häufigkeit der Aminosäuren in beispielsweise E. coli oder der PDB
  • Das durchschnittliche Molekulargewicht einer Aminosäure (~110 Dalton)
  • durchschnittliche Rückgratbreite eines Blattes (5 x 6 Ang) und Helix (12 Ang.) DNAMajor Groove ist übrigens auch 12 Ang.
  • übliche Nicht-Standard-Aminosäuren (Ornithin, Seleneomet usw.).
  • gängige posttranslationale Modifikationen (z. B. T/Y-Phosphorylierung)
  • gemeinsame nicht standardmäßige Sekundärstruktur (3-10 Helix usw.) oder ein kleines Ramachandran-Diagramm
  • pKas von Aminosäuren - denken Sie daran, dass die Ladung bei pH 7 definiert ist
  • der genetische Code

Für Alpha/Beta-Neigungen würde ich die Zahlen von Chou-Fasman verwenden. Es ist ärgerlich, weil in beiden Listen einige Aminosäuren enthalten sind.

Ich werde versuchen, mir mehr auszudenken und später hinzuzufügen ...

Die Antwort finden Sie in jedem Biochemie-Lehrbuch auf Universitätsniveau.

Ich würde Ihnen Lehninger Prinzipien der Biochemie empfehlen , wenn Sie es in Ihrer Universitätsbibliothek finden könnten.

Inhaltsverzeichnis überfliegen, entsprechende Kapitel finden und aufschreiben. Es dauert nicht mehrere Stunden.

Spickzettel zur Proteinbiologie
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