Beim Gentransfer durch Mikroinjektion wird das interessierende Gen ohne Verwendung des Integrase-Enzyms in den Kern der Wirtszelle injiziert. Warum braucht HIV dieses Enzym? Warum platzieren sie ihre DNA nicht einfach in den Zellkern und lassen sie dort bleiben?
Während des Gentransfers durch Mikroinjektion weist die DNA mindestens einige Fragmente mit identischer DNA-Sequenz zum Wirtsgenom auf. Gewöhnlich weist DNA, die für die Mikroinjektion verwendet wird, auf beiden Seiten Flanken auf, die in der Sequenz mit zwei nahe beieinander liegenden, manchmal benachbarten Blöcken der DNA-Sequenz identisch sind. Dies ermöglicht eine homologe Rekombination, die bereits in der Wirtszelle vorhandene Proteine eingreift: https://en.wikipedia.org/wiki/Homologous_recombination
Im Fall von HIV gibt es keine Fragmente mit identischer Sequenz, die das Genom des Virus flankieren, sodass keine homologe Rekombination stattfinden kann, daher ist Integrase erforderlich. Darüber hinaus fügt Integrase virales Genom in zufällige Teile des Wirtsgenoms ein, im Gegensatz zur homologen Rekombination, die dieses virale Genom jedes Mal immer an derselben Stelle lokalisieren würde.
Nun, das ist meine wilde Vermutung, da ich in der Literatur keine wirklichen Beweise finden konnte, aber ich würde sagen, dass es dem Virus einen gewissen Vorteil verschafft. Die ortsspezifische Insertion könnte im Laufe der Evolution durch Mutationen im Wirtsgenom leicht gehemmt und schließlich das Virus eliminiert werden. Dies ist bei der zufälligen Zuordnung nicht der Fall, da keine Mutationen im Wirtsgenom die Integrationswahrscheinlichkeit jemals wesentlich ändern werden.
Hier ist eine gute Übersicht über den Prozess der DNA-Integration in Bezug auf HIV: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3385939/
Lassen Sie mich wissen, ob das hilft, konfrontieren Sie Ihre Meinungen mit dem, was ich denke.
Beifall,
Krzysztof