Vor kurzem habe ich über DNA geforscht und ich weiß, dass die beliebteste Methode zum Nachweis von Viren auf DNA basiert. Nachdem ich etwas über Proteine gelernt habe, frage ich mich, warum wir Viren nicht anhand von Virusproteinen erkennen?
Wenn es wahr wird, können wir eine Menge Geld sparen, anstatt eine PCR-Reaktion durchzuführen, können wir mehr als eine Krankheit in einer einzigen Reaktion nachweisen.
Wenn ich zum Beispiel die Sequenz eines Virus aus der NCBI-Genbank habe, kann ich wissen, wie viele Proteine der Zielorganismus produziert, und ich kann das Molekulargewicht jedes Proteins berechnen. Wenn ich es dann in einem SDS-PAGE-Gel laufen lasse, um zu sehen, wie die Banden aussehen, kann es sein, dass ich wissen kann, ob der Zielorganismus vorhanden ist oder nicht?
Beispielsweise produziert HIV 9 Proteine und das Molekulargewicht jedes Proteins ist unterschiedlich. Nach der Elektrophorese habe ich also 9 Banden. Basierend auf dem Abstand zwischen den einzelnen Banden und basierend auf dem Molekulargewicht ist es möglich zu wissen, ob HIV vorhanden ist oder nicht?
Einfach ausgedrückt lautet die Antwort, dass Sie versuchen könnten, virale Proteine nachzuweisen, aber da diese Proteine sehr kleine Bestandteile Ihrer Probe wären, müssten Sie eine Immunoblotting-Technik verwenden, um ein spezifisches virales Protein nachzuweisen. Obwohl Immunoblotting eine ziemlich empfindliche Technik ist, denke ich, dass es fair ist zu sagen, dass es technisch anspruchsvoll sein kann. Im Gegensatz dazu ist eine PCR-Reaktion außerordentlich empfindlich und ziemlich robust. Die PCR ist auch technisch einfacher, da DNA im Allgemeinen einfacher zu handhaben ist als Proteine.
Vor dem Aufkommen der PCR wäre Immunoblotting die Methode der Wahl gewesen.
Shigeta
Terdon
Atl-LED